RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TGFAP01135 160 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 ADMP35318 185 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 BSPH1Q075Z2 132 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 SCGB2A2Q13296 93 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 PRSS57Q6UWY2 283 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 MRGPRGQ86SM5 289 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 OR1N2Q8NGR9 330 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 RNF7Q9UBF6 113 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 DPRXA6NFQ7 191 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 LYNX1G3V0Z9 82 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 CLEC3BP05452 202 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 LYNX1P0DP58 116 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 ERVK-16P61578 105 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 C1orf174Q8IYL3 243 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 IGFBPL1Q8WX77 278 aa12.32□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 FAM87AP0C7U9 286 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 LGALS7P47929 136 aa12.32□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 STXBP6Q8NFX7 210 aa12.32□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa12.32□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 LHBP01229 141 aa12.31□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.31□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 TREML4Q6UXN2 200 aa12.31□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa12.31□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa12.31□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 LINC00310P59036 64 aa12.31□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 GFRALQ6UXV0 394 aa12.31□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 ZNF114Q8NC26 417 aa12.31□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 LRFN3Q9BTN0 628 aa12.31□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 DSCAML1Q8TD84 2053 aa12.3□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.3□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa12.3□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PPV4 95 aa12.3□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 C11orf94C9JXX5 98 aa12.3□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 NDUFB4O95168 129 aa12.3□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa12.3□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 PAFAH1B2P68402 229 aa12.3□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 FAM57AQ8TBR7 257 aa12.29□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa12.29□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 C1orf159Q96HA4 380 aa12.29□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 CHODLQ9H9P2 273 aa12.29□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 C16orf97H3BN30 126 aa12.27□□□□□ -0.44
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CTIF-205ENST00000587860 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 LCN12Q6JVE5 192 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 GTSF1LQ9H1H1 148 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 F2RL2O00254 374 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 LY6HO94772 140 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 CGB3P0DN86 165 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 CGB7P0DN87 165 aa12.27□□□□□ -0.45
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