RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF114Q8NC26 417 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR5T1Q8NG75 326 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2T10Q8NGZ9 312 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PPQ1 181 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCL21O00585 134 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACTL6BO94805 426 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHV2-70P01814 119 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COL8A2P25067 703 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCN2P80188 198 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C4orf17Q53FE4 359 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UHRF2Q96PU4 802 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAXQ9Y2V3 346 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGLV1-47P01700 117 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SOD3P08294 240 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1QTNF9P0C862 333 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRNP28799 593 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 S100A2P29034 98 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAS2R45P59539 299 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SFRP2Q96HF1 295 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BTF3L4Q96K17 158 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NIT2Q9NQR4 276 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa13.31□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSMB11A5LHX3 300 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C9JCJ5 164 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A17O43808 307 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBP4P02753 201 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRRX1P54821 245 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXL1Q12952 345 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSG5Q15238 335 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEX45Q8NA69 505 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF503Q96F45 646 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PITPNC1Q9UKF7 332 aa13.3□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LYNX1G3V0Z9 82 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LYNX1P0DP58 116 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2T6Q8NHC8 308 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OCC1Q8TAD7 63 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C8orf46Q8TAG6 207 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RITA1Q96K30 269 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF2Q99496 336 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PPI3 338 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BEND2Q8NDZ0 799 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR61Q9BZJ8 451 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.29□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLXNB1O43157 2135 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRYGBP07316 175 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C8orf88P0DMB2 117 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADORA2A-AS1P86434 159 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLEC12BQ2HXU8 276 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEX38Q6PEX7 206 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THAP8Q8NA92 274 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACY3Q96HD9 319 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLEC7AQ9BXN2 247 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR51M1Q9H341 326 aa13.28□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa13.27□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MMD2Q8IY49 270 aa13.27□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.27□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PRE2 83 aa13.27□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa13.27□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ENSAO43768 121 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR7C2O60412 319 aa13.27□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGLC7A0M8Q6 106 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FABP1P07148 127 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPIAL4GP0DN37 164 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDSNQ15517 529 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRSS8Q16651 343 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PYY3Q5JQD4 70 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR10G8Q8NGN5 311 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PFDN5Q99471 154 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.26□□□□□ -0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms