RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMB6	P28072	239 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	THYN1	Q9P016	225 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA17	P01571	189 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM187	Q14656	261 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NECAP1	Q8NC96	275 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TENM3	Q9P273	2699 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SORL1	Q92673	2214 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MZ25	164 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-5	P01602	117 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYGC	P07315	174 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.23	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G10	O15496	165 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	UPK1B	O75841	260 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GP9	P14770	177 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MYOD1	P15172	320 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CTRB1	P17538	263 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFA1	P59665	94 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFA3	P59666	94 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOG	P84095	191 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424		U3KQK5	164 aa		13.22	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0B4J2A0	478 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424		E7EUB6	86 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SFT2D2	O95562	160 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LY86	O95711	162 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	AREG	P15514	252 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SPN	P16150	400 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PRCD	Q00LT1	54 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	C4orf46	Q504U0	113 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		13.21	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	REG1A	P05451	166 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SNCA	P37840	140 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	ASAH1	Q13510	395 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	COQ8A	Q8NI60	647 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		13.2	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0B4J293	547 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2J3	O76001	311 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	PRH1	P02810	166 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	TCRB	P04435	133 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4E1	P0C645	316 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424		P0C879	139 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SPCS3	P61009	180 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R1A	Q13522	171 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.19	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GW64	132 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf170	A2RU37	121 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA21	P01568	189 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	BTC	P35070	178 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf32	Q32M92	178 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		13.18	□□□□□ -0.3
HDAC10-216	ENST00000489424	LYG2	Q86SG7	212 aa		13.18	□□□□□ -0.3

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