RNA–Protein interactions for RNA: YJL178C

ATG27, Transcript of Type I membrane protein involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG27, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG27	YJL178C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YGL081W	P53156	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YHM2	Q04013	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	VHS3	Q08438	674 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	SWI6	P09959	803 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	PET127	P32606	800 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	SEC6	P32844	805 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	OAF3	P36023	863 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	BIT2	P38346	545 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	PIG2	P40187	538 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YJR120W	P47157	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	ATG4	P53867	494 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	HFI1	Q12060	488 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	TAF3	Q12297	353 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	TMA17	Q12513	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ATG27	YJL178C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	EUG1	P32474	517 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	TDP1	P38319	544 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YJL206C	P39529	758 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	BDH2	P39713	417 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	TAH11	P47112	604 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	CTR1	P49573	406 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	MLH3	Q12083	715 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	POM34	Q12445	299 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	ABF1	P14164	731 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	KIN82	P25341	720 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	BCS1	P32839	456 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YPT7	P32939	208 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	GLG1	P36143	616 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	VPS15	P22219	1454 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	NUP159	P40477	1460 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	IME1	P21190	360 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	SEC15	P22224	910 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	DID4	P36108	232 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	BIT61	P47041	543 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YML122C	Q03207	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	STP4	Q07351	490 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	USV1	Q12132	391 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	ATF1	P40353	525 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YIL166C	P40445	542 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YIL077C	P40508	320 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	VID28	P40547	921 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	BUD8	P41698	603 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	PPN1	Q04119	674 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	SPO14	P36126	1683 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	NTH1	P32356	751 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	EMP70	P32802	667 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	DUN1	P39009	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	RFX1	P48743	811 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	APM4	Q99186	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	BNR1	P40450	1375 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	BUD3	P25558	1636 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	RPN13	O13563	156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	CDC26	P14724	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	ATP12	P22135	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	FUB1	P25659	250 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	SET3	P36124	751 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	FLO10	P36170	1169 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	CTP1	P38152	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YBR071W	P38243	211 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	COS111	P38308	924 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	IES1	P43579	692 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	MPS3	P47069	682 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	FOL1	P53848	824 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YFT2	Q06676	274 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	PDR10	P51533	1564 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	GMH1	P36125	273 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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