RNA–Protein interactions for RNA: YJL028W

YJL028W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YJL028W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL028W	YJL028W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	PSF2	P40359	213 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	PRM2	P40534	656 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	CTH1	P47976	325 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	MRPS35	P53292	345 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	SNO2	P53823	222 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	ACS1	Q01574	713 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	NRG1	Q03125	231 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	PPN1	Q04119	674 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	VID22	Q05934	901 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	TGL5	Q12043	749 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	HOS1	Q12214	470 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	JNM1	P36224	373 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	ESL1	P40456	1118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	YAP6	Q03935	383 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	AAD4	Q07747	329 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	MED7	Q08278	222 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	TRM8	Q12009	286 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	SAN1	P22470	610 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	VPS8	P39702	1274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	GET2	P40056	285 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	TAH11	P47112	604 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	YDL183C	P48569	320 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	SPO1	P53541	631 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	GAD1	Q04792	585 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	RXT3	Q07458	294 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	POM34	Q12445	299 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	TRM11	Q12463	433 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJL028W	YJL028W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	RIT1	P23796	513 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	KIN82	P25341	720 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	NFU1	P32860	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	CTF13	P35203	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	SET3	P36124	751 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
YJL028W	YJL028W	ICP55	P40051	511 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	CTF18	P49956	741 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	MDR1	P53258	950 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	MDG1	P53885	366 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	GCN5	Q03330	439 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	CRD1	Q07560	283 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	TUP1	P16649	713 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	KAR4	P25583	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	CDC20	P26309	610 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	PAH1	P32567	862 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	LYS9	P38999	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	PLB1	P39105	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	YER010C	P40011	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	FTR1	P40088	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	GSM1	P42950	618 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	SRB7	P47822	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	MTL1	P53214	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	SDH5	Q08230	162 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	ERP4	Q12450	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	ENT1	Q12518	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	FOB1	O13329	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	AAC3	P18238	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	PEX1	P24004	1043 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	EHT1	P38295	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	NPR3	P38742	1146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	SFB3	P38810	929 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	YEL068C	P39977	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	FKH2	P41813	862 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	SAP4	P53036	818 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	IMA1	P53051	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	MRPL22	P53881	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	CBK1	P53894	756 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	ERG5	P54781	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	THI22	Q06490	572 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJL028W	YJL028W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.9 ms