RNA–Protein interactions for RNA: YHR077C

NMD2, Transcript of Protein involved in the nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway, yeast

Gene NMD2, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD2	YHR077C	REV7	P38927	245 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YDR089W	P38966	869 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	KTR7	P40504	517 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	MAF1	P41910	395 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YJR142W	P47173	342 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	CDC55	Q00362	526 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	CDC73	Q06697	393 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	LCB4	Q12246	624 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	MAM3	Q12296	706 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	PDR1	P12383	1068 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	KIP2	P28743	706 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	RGT1	P32862	1170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	BEM3	P32873	1128 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SEG2	P34250	1132 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	HEL1	P36113	551 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	ETR1	P38071	380 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SMF2	P38778	549 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	AVT2	P39981	480 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	JJJ3	P47138	172 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	MDR1	P53258	950 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	TFB2	Q02939	513 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SHE9	Q04172	456 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	PRM6	Q04705	352 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	EMP46	Q12396	444 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	HSM3	P38348	480 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	RRT5	P43607	289 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	ALT1	P52893	592 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	NUT1	P53114	1132 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	MUK1	Q02866	612 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YMR160W	Q03823	816 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	OSW2	Q12202	724 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	IZH4	Q99393	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	UBR1	P19812	1950 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	MEI4	P29467	408 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	UTR2	P32623	467 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	VRP1	P37370	817 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	RFC3	P38629	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YAP1801	P38856	637 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	TVP23	P38962	199 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YIL054W	P40524	105 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
NMD2	YHR077C	SUM1	P46676	1062 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YML6	P51998	286 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YML020W	Q03722	664 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YET3	Q07451	203 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	AIM39	Q08223	395 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YLL058W	Q12198	575 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	ATG11	Q12527	1178 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	KAR4	P25583	335 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	EDS1	P38073	919 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	RIM4	P38741	713 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	INP52	P50942	1183 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	PCL10	P53124	433 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	BIO4	P53630	237 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YNL011C	P53980	444 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
NMD2	YHR077C	RMD5	Q12508	421 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	INO1	P11986	533 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SPO16	P17122	198 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	TIM23	P32897	222 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SRB2	P34162	210 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	CCL1	P37366	393 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	RIM2	P38127	377 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	SIF2	P38262	535 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	STN1	P38960	494 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	CHS6	P40955	746 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	TPO2	P53283	614 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	BUD32	P53323	261 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YPR003C	P53394	754 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YNL108C	P53929	270 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	ARO80	Q04052	950 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	ALR1	Q08269	859 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YPT6	Q99260	215 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	RAD3	P06839	778 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	WHI2	P12611	486 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	VAN1	P23642	535 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NMD2	YHR077C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91

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