RNA–Protein interactions for RNA: YFR009W

GCN20, Transcript of Positive regulator of the Gcn2p kinase activity, yeast

Gene GCN20, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN20	YFR009W	ETR1	P38071	380 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YHR054C	P38780	354 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	RSC30	P38781	883 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	CKB2	P38930	258 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	FLC2	P39719	783 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ACF4	P47129	309 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YJR142W	P47173	342 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ERP6	P53198	216 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	FMN1	Q03778	218 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	HFD1	Q04458	532 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YLL056C	Q12177	298 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	AAD3	P25612	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	PRK1	P40494	810 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YIL054W	P40524	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YJR054W	P47114	497 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ALT1	P52893	592 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	RCF2	P53721	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ARO80	Q04052	950 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	FMP25	Q08023	583 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YRR1	Q12172	810 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	VPS5	Q92331	675 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	GPA2	P10823	449 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	WHI2	P12611	486 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	REC107	P21651	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	CLB4	P24871	460 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	SEC6	P32844	805 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	PPX1	P38698	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ALG5	P40350	334 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	MND2	P40577	368 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ZAP1	P47043	880 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YNL058C	P53947	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	UBX4	P54730	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	HOT1	Q03213	719 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YML020W	Q03722	664 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YET3	Q07451	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ADY3	Q07732	790 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	PEX2	P32800	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	TFC3	P34111	1160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YBL036C	P38197	257 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YBP1	P38315	674 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	LYS9	P38999	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YJL107C	P42947	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ISM1	P48526	1002 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	MIG2	P53035	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	BIO4	P53630	237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	EMP46	Q12396	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	MOT1	P32333	1867 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	KEX2	P13134	814 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	VBA3	P25594	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	RGT1	P32862	1170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	SRB2	P34162	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	VBA5	P36172	582 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	PNT1	P38969	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	JEM1	P40358	645 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	TPO2	P53283	614 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	TPO1	Q07824	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	CDC20	P26309	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YUR1	P26725	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	PRR1	P28708	518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	KDX1	P36005	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	GEM1	P39722	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	FRT2	P39734	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ULI1	P43604	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	ALY2	P47029	1046 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	TAH11	P47112	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	NUT1	P53114	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	YPR003C	P53394	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN20	YFR009W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
GCN20	YFR009W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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