RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT15	YER148W	FAT1	P38225	669 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	IES1	P43579	692 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	BIT61	P47041	543 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	TEL2	P53038	688 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	SLI1	P53304	468 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	COG6	P53959	839 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	SKY1	Q03656	742 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	YPS7	Q06325	596 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	PNS1	Q12412	539 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	MLP2	P40457	1679 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	IME1	P21190	360 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PPS1	P38148	807 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	BIT2	P38346	545 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	YHL017W	P38745	532 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	YNL195C	P40168	261 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	YJR120W	P47157	116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	NSE5	Q03718	556 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PPN1	Q04119	674 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	VPS36	Q06696	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	ACF2	Q12168	779 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	POM34	Q12445	299 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	ECM3	Q99252	613 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
SPT15	YER148W	PRP28	P23394	588 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	KIN82	P25341	720 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	OAR1	P35731	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	STP4	Q07351	490 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	CDC26	P14724	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	TOM20	P35180	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	EMP65	P40085	556 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	VID28	P40547	921 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PXA1	P41909	870 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	FHN1	P53279	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	FOL1	P53848	824 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	TIM44	Q01852	431 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
SPT15	YER148W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	DAL3	P32459	195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	BCS1	P32839	456 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
SPT15	YER148W	DUN1	P39009	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PIG2	P40187	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	BUD8	P41698	603 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	SSL2	Q00578	843 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PHO11	P35842	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	MOH1	P38191	138 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PHO12	P38693	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	SFB3	P38810	929 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	TAF4	P50105	388 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	SLD3	P53135	668 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	SPO1	P53541	631 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	SEC15	P22224	910 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PEX14	P53112	341 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	SPC105	P53148	917 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	MUK1	Q02866	612 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	PEX15	Q08215	383 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	MCH5	Q08777	521 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPT15	YER148W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	PRE4	P30657	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	PLC1	P32383	869 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	PCL5	P38794	229 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	STB4	P50104	949 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	ATG4	P53867	494 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	HLR1	Q04429	423 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	YFT2	Q06676	274 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	ATP12	P22135	325 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	DGR2	P32330	852 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	HXT4	P32467	576 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	COS111	P38308	924 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	ARG2	P40360	574 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	YIL077C	P40508	320 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	IRC5	P43610	853 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	FDC1	Q03034	503 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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