RNA–Protein interactions for RNA: YDR057W

YOS9, Transcript of ER quality-control lectin, yeast

Gene YOS9, Length 1,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOS9	YDR057W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SSN2	P38931	1420 aa		7.01	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	HIS3	P06633	220 aa		7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	MNE1	P24720	663 aa		7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	BEM3	P32873	1128 aa		7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	MSN4	P33749	630 aa		7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	YHR054C	P38780	354 aa		7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PRM9	P39551	298 aa		7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	APP1	P53933	587 aa		7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	KTR6	P54070	446 aa		7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	VPS36	Q06696	566 aa		7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	TUS1	Q06412	1307 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PAH1	P32567	862 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	UBX7	P38349	436 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	OSW5	P40219	148 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SAM37	P50110	327 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	ROM1	P53046	1155 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	INA17	Q02888	182 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	YCG1	Q06680	1035 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	GRS2	Q06817	618 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	VAM6	Q07468	1049 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.99	□□□□□ -1.29	not detected
YOS9	YDR057W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	RBD2	Q12270	262 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SKS1	Q12505	502 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	GYP6	P32806	458 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SUR1	P33300	382 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	MTH1	P35198	433 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	RAD55	P38953	406 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	HXT8	P40886	569 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	CIR1	P42940	261 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	KAP114	P53067	1004 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	LCL3	P53153	274 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	YGR122W	P53272	402 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	CIK1	Q01649	594 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	MUK1	Q02866	612 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	YPL107W	Q02873	248 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	FRE6	Q12473	712 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PRB1	P09232	635 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	AAC3	P18238	307 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	RPC34	P32910	317 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	RFC3	P38629	340 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PCI8	P40512	444 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	BRE2	P43132	505 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	JJJ2	P46997	583 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	STB4	P50104	949 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	TIM10	P87108	93 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	DYN3	Q04949	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SYO1	Q07395	620 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SFI1	Q12369	946 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	TRP3	P00937	484 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.97	□□□□□ -1.29	not detected
YOS9	YDR057W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	ROX1	P25042	368 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	CHK1	P38147	527 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	SIF2	P38262	535 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	FLC2	P39719	783 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	GIP4	P39732	760 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	QDR1	P40475	563 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	MNT4	P53745	580 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	DSE4	P53753	1117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	ESBP6	P53918	673 aa		6.97	□□□□□ -1.29
YOS9	YDR057W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29

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