RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 TRIM27P14373 513 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 MTX1Q13505 466 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 GRIK5Q16478 980 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 TEKT1Q969V4 418 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 MAST3O60307 1309 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 PRKG1Q13976 671 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 SPRYD7Q5W111 196 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 SIL1Q9H173 461 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 BCAR3O75815 825 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 SREBF2Q12772 1141 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 ATP2B3Q16720 1220 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 TNNI2P48788 182 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 INHBEP58166 350 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 TEPSINQ96N21 525 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 SEMA3EO15041 775 aa22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 SRGAP3O43295 1099 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 FZD1Q9UP38 647 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 GNAI2P04899 355 aa22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 DGKZQ13574 1117 aa22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 FAM83AQ86UY5 434 aa22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 ALDH1A1P00352 501 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 WNK4Q96J92 1243 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-201ENST00000330334 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 TBC1D8O95759 1140 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 PHKA1P46020 1223 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC102BQ68D86 513 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 HOOK2Q96ED9 719 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 TNNQ9UQP3 1299 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 TIMM10P62072 90 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 IFNL1Q8IU54 200 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 MAP3K9P80192 1104 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 A0A1B0GUL7 405 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 GPR25O00155 361 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 PRDX5P30044 214 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 ADORA1P30542 326 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 CACNB3P54284 484 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 TFCP2Q12800 502 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 GJA5P36382 358 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 RGS19P49795 217 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 XAGE2Q96GT9 111 aa21.96■■□□□ 1.11
HDDC3-201ENST00000330334 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-201ENST00000330334 RASGRF1Q13972 1273 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-201ENST00000330334 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-201ENST00000330334 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-201ENST00000330334 FAM151AQ8WW52 585 aa21.95■■□□□ 1.1
HDDC3-201ENST00000330334 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
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