RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583689.5

NAT9-223, Transcript of N-acetyltransferase 9 (putative), human

TSL 2

Gene NAT9, Length 563 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAT9-223	ENST00000583689	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	IGF1	P05019	195 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	PSMD7	P51665	324 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689		K7EIL1	84 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RAB29	O14966	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	SLC6A1	P30531	599 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	FOXE3	Q13461	319 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	P2RX4	Q99571	388 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	IFITM5	A6NNB3	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	PDCD5	O14737	125 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	NBR2	O15453	112 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	IGHG4	P01861	327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	VDAC1	P21796	283 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	ZBTB25	P24278	435 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	CEACAM6	P40199	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	MYCNOS	P40205	109 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	NPB	Q8NG41	125 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	DPF1	Q92782	380 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689		A0A0B4J203	849 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	PROP1	O75360	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	NDUFA3	O95167	84 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	ELANE	P08246	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	GAL	P22466	123 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	MYL9	P24844	172 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	PTX4	Q96A99	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	COL7A1	Q02388	2944 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689		G3V318	75 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689		H0YJW9	148 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	HSPA12A	O43301	675 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RAB3B	P20337	219 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	PSMB8	P28062	276 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RANBP1	P43487	201 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	OR51J1	Q9H342	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NAT9-223	ENST00000583689	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NAT9-223	ENST00000583689	CCL24	O00175	119 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NAT9-223	ENST00000583689	RAB27B	O00194	218 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NAT9-223	ENST00000583689	MFNG	O00587	321 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms