RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE6AA0A183 80 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1B0GW55 424 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR5B21A6NL26 309 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAAR5O14804 337 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FABP7O15540 132 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC22A5O76082 557 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACSM4P0C7M7 580 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUX4L2P0CJ85 424 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUX4L3P0CJ86 424 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUX4L4P0CJ87 422 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUX4L5P0CJ88 424 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUX4L6P0CJ89 424 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUX4L7P0CJ90 424 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CXCR1P25024 350 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNFSF8P32971 234 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDH12P55289 794 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PROK1P58294 105 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TGFBR3Q03167 851 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNC119Q13432 240 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMIM21Q3B7S5 101 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SKA3Q8IX90 412 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEX45Q8NA69 505 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UFD1Q92890 307 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF524Q96C55 264 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAB3CQ96E17 227 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BTF3L4Q96K17 158 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGDIGQ99819 225 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NRN1Q9NPD7 142 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM206AQ9NX38 181 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUX4Q9UBX2 424 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CES1P1Q9UKY3 287 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGSF23A1L1A6 192 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C5orf63A6NC05 138 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRORSD1PA6NEY8 169 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM25AB3EWG3 89 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM25CB3EWG5 89 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM25GB3EWG6 89 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRDCB7Z8K6 153 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RHODO00212 210 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1D-16P01601 117 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV2-5P01817 119 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFNA4P05014 189 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 S100A8P05109 93 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CECR9P0C854 216 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFI30P13284 250 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD1DP15813 335 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRPRP30550 384 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHBP35232 272 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCTAP57738 103 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNG3P63215 75 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARL16Q0P5N6 197 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ST3GAL4Q11206 333 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LAGE3Q14657 143 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GINS1Q14691 196 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRSS8Q16651 343 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM153CQ494X1 144 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LIN52Q52LA3 116 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF585BQ52M93 769 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC48A1Q6P1K1 146 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PEX26Q7Z412 305 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR1K1Q8NGR3 316 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR1P1Q8NH06 330 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC01006Q8NI28 216 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFP90Q8TF47 636 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TOMM40LQ969M1 308 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM203Q969S6 136 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RCN3Q96D15 328 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF681Q96N22 645 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SIGMAR1Q99720 223 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AGMATQ9BSE5 352 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms