RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GET2P40056 285 aa0.75□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UFO1Q04511 668 aa0.75□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPR28Q04921 423 aa0.75□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MCM21Q06675 368 aa0.75□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR084WA2P2R3 262 aa0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL7AP05737 244 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCL002CP25565 263 aa0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BIT2P38346 545 aa0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GND1P38720 489 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SET5P38890 526 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MPS3P47069 682 aa0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NIT3P49954 291 aa0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CHS5Q12114 671 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AGP1P25376 633 aa0.73□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VBA3P25594 458 aa0.73□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VBA5P36172 582 aa0.73□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GID8P40208 455 aa0.73□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KHA1P40309 873 aa0.73□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ZIP2P53061 704 aa0.73□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LRS4Q04087 347 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ENV7Q12003 364 aa0.73□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR111WQ12528 110 aa0.73□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS9BP05755 195 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RNR1P21524 888 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LDB16P25587 256 aa0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MGE1P38523 228 aa0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DAK1P54838 584 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TPO3Q06451 622 aa0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STP4Q07351 490 aa0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TIP41Q12199 356 aa0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RDL1Q12305 139 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ZPS1Q12512 249 aa0.72□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GSY2P27472 705 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NTH1P32356 751 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LOT5P34234 306 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPL7P36519 292 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PIH1P38768 344 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EXO1P39875 702 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRC7P43623 340 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TAD1P53065 400 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 REC102Q02721 264 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATX2Q12067 313 aa0.71□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSA1P10591 642 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC20P28791 383 aa0.7□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCT1P32784 759 aa0.7□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR184WP38299 523 aa0.7□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SHR5P41912 237 aa0.7□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNF12P53628 566 aa0.7□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ORC4P54791 529 aa0.7□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 THI22Q06490 572 aa0.7□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRS23Q03784 219 aa0.69□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MLH2Q07980 695 aa0.69□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CPA2P03965 1118 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRP40P32583 406 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPT3P33298 428 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 THI6P41835 540 aa0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NOP9P47077 666 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL071CQ02864 156 aa0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RMD1Q03441 430 aa0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR071WQ12346 211 aa0.68□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCO2P38072 301 aa0.67□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ZDS1P50111 915 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HMO1Q03973 246 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SHE9Q04172 456 aa0.67□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR352WQ06479 807 aa0.67□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC3P33332 1336 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FEN2P25621 512 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CPR3P25719 182 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COQ3P27680 312 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC6P32844 805 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SWH1P35845 1188 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ELF1P36053 145 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FYV10P40492 516 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL092WP40497 633 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RSC8P43609 557 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RFX1P48743 811 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COX18P53239 316 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR182C-AQ8TGU6 64 aa0.66□□□□□ -2.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HES1P35843 434 aa0.65□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RKM3P38222 552 aa0.65□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COQ6P53318 479 aa0.65□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CRZ1P53968 678 aa0.65□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ECM3Q99252 613 aa0.65□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DIF1O13577 133 aa0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 WHI2P12611 486 aa0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC11P32458 415 aa0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSS1P32559 526 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RLP7P40693 322 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNL018CP53976 612 aa0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NAN1Q02931 896 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR281CQ05863 155 aa0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 REH1Q06709 432 aa0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDL073WQ07454 984 aa0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FAL1Q12099 399 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.8 ms