RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W SNF7P39929 240 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W GDS1P41913 522 aa3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YFL052WP43551 465 aa3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W LSB3P43603 459 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.15□□□□□ -1.91 RIP-Chip
SIN3YOL004W CCT8P47079 568 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SHE10P53075 577 aa3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TUB2P02557 457 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W LHS1P36016 881 aa3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ERP4Q12450 207 aa3.15□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W CTM1P38818 585 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YAP5P40574 245 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ZAP1P47043 880 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YJR079WP47126 109 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W COX18P53239 316 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W COQ6P53318 479 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SEG1Q04279 960 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W GPI13Q07830 1017 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W BDS1Q08347 646 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ABF1P14164 731 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W CWP1P28319 239 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W BOL3P39724 118 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YJL171CP46992 396 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RED1P14291 827 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W CSM3Q04659 317 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PLP2Q12017 286 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W MCD1Q12158 566 aa3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RML2P32611 393 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PCM1P38628 557 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RAD17P48581 401 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PYK2P52489 506 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W REC8Q12188 680 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ISF1P32488 338 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ACS2P52910 683 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ADA2Q02336 434 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W LSO1Q3E827 93 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PHO2P07269 559 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W DCW1P36091 449 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W STB5P38699 743 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SLZ1P40167 298 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W LTP1P40347 161 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W NDJ1Q12366 352 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SMC1P32908 1225 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TBS1P38114 1094 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W REI1P38344 393 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W JJJ1P53863 590 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YDL073WQ07454 984 aa3.13□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W CIT1P00890 479 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W GAL4P04386 881 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W HEM2P05373 342 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ELM1P32801 640 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PRS3P38689 320 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FLC3P53121 802 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W UTP8P53276 713 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SPR28Q04921 423 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W STE13P33894 931 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W NUP133P36161 1157 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SKM1Q12469 655 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W HTA1P04911 132 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W HTA2P04912 132 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W KHA1P40309 873 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PDR16P53860 351 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W HSP60P19882 572 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SBA1P28707 216 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TRM2P33753 639 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W YMR018WQ04364 514 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W GRX8Q05926 109 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TGL5Q12043 749 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FRT1Q99332 602 aa3.12□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W ATP4P05626 244 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W NUD1P32336 851 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W FUI1P38196 639 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W SIP5P40210 489 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W GSY1P23337 708 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W GRR1P24814 1151 aa3.11□□□□□ -1.91
SIN3YOL004W PEX5P35056 612 aa3.11□□□□□ -1.91
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