RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	FAT1	P38225	669 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	BCD1	P38772	366 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	REV7	P38927	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	LYS9	P38999	446 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	DUN1	P39009	513 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	NUP60	P39705	539 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	GET2	P40056	285 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	UBC11	P52492	156 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	YPR027C	Q12079	277 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	PEX1	P24004	1043 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	FMO1	P38866	432 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	NIT2	P47016	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	COG6	P53959	839 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	SKY1	Q03656	742 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	YPS7	Q06325	596 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	VPS36	Q06696	566 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	SEC15	P22224	910 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	FMP52	P40008	231 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	PEX14	P53112	341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	SPC105	P53148	917 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	TFC4	P33339	1025 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	BIT2	P38346	545 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	VID28	P40547	921 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	PXA1	P41909	870 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	IMO32	P53219	342 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	POM34	Q12445	299 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL171C	YNL171C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	KAR1	P11927	433 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	KIN82	P25341	720 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	HIR1	P32479	840 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	SFB3	P38810	929 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	BIT61	P47041	543 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	SLD3	P53135	668 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PPN1	Q04119	674 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	THI22	Q06490	572 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	STP4	Q07351	490 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
YNL171C	YNL171C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	KIN3	P22209	435 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	DGR2	P32330	852 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PLC1	P32383	869 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	EMP65	P40085	556 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	IES1	P43579	692 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	RIA1	P53893	1110 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	IOC4	Q04213	475 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	ZRT2	Q12436	422 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	CDC43	P18898	376 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	IME1	P21190	360 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	BCS1	P32839	456 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	GRX7	P38068	203 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PIG2	P40187	538 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	BUD8	P41698	603 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	TEL2	P53038	688 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	YAP1802	P53309	568 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	SIR3	P06701	978 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	CDC26	P14724	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	YPT7	P32939	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PHO11	P35842	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PHO12	P38693	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
YNL171C	YNL171C	PEA2	P40091	420 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	YIL077C	P40508	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	TAF4	P50105	388 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	SSL2	Q00578	843 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	ARO10	Q06408	635 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	ATP12	P22135	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PRP28	P23394	588 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	COS111	P38308	924 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	NSE5	Q03718	556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PHM6	Q05637	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	COQ11	Q05892	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	PEX15	Q08215	383 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
YNL171C	YNL171C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	HXT4	P32467	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	SEC6	P32844	805 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL171C	YNL171C	YHR033W	P38690	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 80.5 ms