RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	RGR1	P19263	1082 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
YNL057W	YNL057W	SFP1	P32432	683 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	RML2	P32611	393 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	XRS2	P33301	854 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	GEM1	P39722	662 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	THI6	P41835	540 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	DAS1	P47005	663 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	IME1	P21190	360 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	KDX1	P36005	433 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	RFC5	P38251	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	HEM14	P40012	539 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	FTR1	P40088	404 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YJR061W	P40355	935 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	SMC3	P47037	1230 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	VEL1	P53058	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	COQ6	P53318	479 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	TBF1	Q02457	562 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	FOB1	O13329	566 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	DSS4	P32601	143 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	STE13	P33894	931 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	WSC4	P38739	605 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	PPE1	P38796	400 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	FHL1	P39521	936 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YER158C	P40095	573 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	GUF1	P46943	645 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	PSR2	Q07949	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	GAL10	P04397	699 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	RGP1	P16664	663 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	TEC1	P18412	486 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	RRT12	P25381	491 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	TRK2	P28584	889 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	CBF2	P32504	956 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	LTP1	P40347	161 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	LCB2	P40970	561 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	CDC1	P40986	491 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	RRN7	P40992	514 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	UFE1	P41834	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	DAK2	P43550	591 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YJR054W	P47114	497 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	PEX13	P80667	386 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	COG8	Q04632	607 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	MLH2	Q07980	695 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	DDC1	Q08949	612 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	NBP2	Q12163	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	SWI3	P32591	825 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	UME6	P39001	836 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	DSE1	P40077	573 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	UBP7	P40453	1071 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	RSM25	P40496	264 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	VTC4	P47075	721 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	NUP84	P52891	726 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	AQR1	P53943	586 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	TIM8	P57744	87 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	DON1	Q05610	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	ELG1	Q12050	791 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL057W	YNL057W	CHS2	P14180	963 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SCJ1	P25303	377 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PFS1	P38872	237 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	DUN1	P39009	513 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PSY2	P40164	858 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	COQ5	P49017	307 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNL057W	YNL057W	FLC3	P53121	802 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11 ms