RNA–Protein interactions for RNA: YMR270C

RRN9, Transcript of Protein involved in promoting high level transcription of rDNA, yeast

Gene RRN9, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	YMR270C	HDA1	P53973	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	HIR1	P32479	840 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SUL1	P38359	859 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	CIT3	P43635	486 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	GCV1	P48015	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	ASE1	P50275	885 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	ATG16	Q03818	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	CSM3	Q04659	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YIG1	Q08956	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	CEX1	Q12453	761 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	ARP6	Q12509	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	DFG16	Q99234	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	KIN82	P25341	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SYN8	P31377	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MSS51	P32335	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YBR284W	P38150	797 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	EXO5	P38289	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	NDT80	P38830	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	ERP2	P39704	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	COG6	P53959	839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MMR1	Q06324	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	NKP1	Q12493	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MDM12	Q92328	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	ATP4	P05626	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YKL077W	P36081	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MCM7	P38132	845 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YBR071W	P38243	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YHR131C	P38835	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MET13	P53128	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	TGL2	P54857	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	HFI1	Q12060	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	HIF1	Q12373	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	MPD2	Q99316	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN9	YMR270C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
RRN9	YMR270C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	VBA3	P25594	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	DPB3	P27344	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	BAP2	P38084	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	RXT2	P38255	430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TVP23	P38962	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	BUD16	P39988	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	CNN1	P43618	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YKE2	P52553	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	PEX14	P53112	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YGR021W	P53212	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ORC3	P54790	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ORC4	P54791	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MFM1	Q02783	413 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	CRD1	Q07560	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	DAP1	Q12091	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	GSY1	P23337	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	DOM34	P33309	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	DID4	P36108	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	YGL138C	P53122	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	RET3	P53600	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	ARP5	P53946	755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RRN9	YMR270C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN9	YMR270C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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