RNA–Protein interactions for RNA: YMR052W

FAR3, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene FAR3, Length 615 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAR3	YMR052W	CDC9	P04819	755 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	AAD3	P25612	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	APN2	P38207	520 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	PIP2	P52960	996 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	MAL11	P53048	616 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	NHX1	Q04121	633 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	VBA3	P25594	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	YEL1	P34225	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	YGL117W	P53133	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	SNF12	P53628	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	UFO1	Q04511	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAR3	YMR052W	NTH1	P32356	751 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	ORM2	Q06144	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	YFT2	Q06676	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	VPS36	Q06696	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	POM34	Q12445	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	COS111	P38308	924 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	FRE7	Q12333	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	HOG1	P32485	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	ELF1	P36053	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	CPR8	P53728	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	MDM12	Q92328	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	CIT2	P08679	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	IRC8	P47046	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	STE4	P18851	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	MNN4	P36044	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	IRC3	Q06683	689 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	IZH3	Q07959	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	SEC15	P22224	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	BEM3	P32873	1128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	ATP23	P53722	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAR3	YMR052W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	YPT7	P32939	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	YHR202W	P38887	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	BIT61	P47041	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	GSY1	P23337	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	EUG1	P32474	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	DSS1	P39112	969 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	TRS23	Q03784	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	NSE3	Q05541	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	TUP1	P16649	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	PMA2	P19657	947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	KIN82	P25341	720 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	NMD5	P46970	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	VHS3	Q08438	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	SRD1	P09007	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
FAR3	YMR052W	RIM4	P38741	713 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	MEF1	P25039	761 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	MRPL9	P31334	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	ATG36	P46983	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	PET127	P32606	800 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	THI6	P41835	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	AIM14	P53109	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAR3	YMR052W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	ATG33	Q06485	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	DCS2	Q12123	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	PIH1	P38768	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	HMG1	P12683	1054 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	PXL1	P36166	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	SNO3	P43544	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	RSC9	Q03124	581 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	MNT3	P40549	630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	TSR4	P25040	408 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	RPC34	P32910	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	SPC97	P38863	823 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	PCI8	P40512	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	NNF1	P47149	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAR3	YMR052W	COG8	Q04632	607 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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