RNA–Protein interactions for RNA: YLL006W

MMM1, Transcript of ER integral membrane protein, ERMES complex subunit, yeast

Gene MMM1, Length 1,281 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MMM1	YLL006W	TDA3	P38758	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	HIS6	P40545	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	SAP185	P40856	1058 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	MEH1	Q02205	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	ATP25	Q03153	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	MET7	Q08645	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	BIT2	P38346	545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	GYP8	P43570	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	IML2	P47031	731 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	AIM14	P53109	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	REH1	Q06709	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	SGO1	Q08490	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	TGL5	Q12043	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MMM1	YLL006W	PER1	P25625	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SWI3	P32591	825 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	EMC3	P36039	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	FLO10	P36170	1169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	EXO84	P38261	753 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YHL041W	P38730	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SRB7	P47822	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	TAD1	P53065	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	IMO32	P53219	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SSL2	Q00578	843 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	NHX1	Q04121	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	ASM4	Q05166	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	ATG33	Q06485	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	MDM10	P18409	493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	DBF20	P32328	564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	MCD4	P36051	919 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SAP190	P36123	1033 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	BCD1	P38772	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YIL166C	P40445	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	BFA1	P47113	574 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YML131W	Q03102	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SKY1	Q03656	742 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	COQ11	Q05892	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	HMG1	P12683	1054 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YKU70	P32807	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	HSL7	P38274	827 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	ACA1	P39970	489 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	FMP52	P40008	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	TMA108	P40462	946 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	RET2	P43621	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	ALY2	P47029	1046 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	ARO10	Q06408	635 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	PEX15	Q08215	383 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	THI21	Q08975	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	CHS3	P29465	1165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	DAL3	P32459	195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	RRN3	P36070	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	UBC11	P52492	156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	TEL2	P53038	688 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SPC19	Q03954	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	GRC3	Q07845	632 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	DAL5	P15365	543 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	MUM2	P38236	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	MNT3	P40549	630 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SHR5	P41912	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YHM2	Q04013	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	GPR1	Q12361	961 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	DMC1	P25453	334 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YBR259W	P38338	688 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	NDE1	P40215	560 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	BNA2	P47125	453 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	ECM9	Q02202	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	HOF1	Q05080	669 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	OPY2	Q06810	360 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MMM1	YLL006W	SSM4	P40318	1319 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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