RNA–Protein interactions for RNA: YKL086W

SRX1, Transcript of Sulfiredoxin, yeast

Gene SRX1, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRX1	YKL086W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	EMP46	Q12396	444 aa		18.27	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	AEP2	P22136	580 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	SFB3	P38810	929 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	YGR111W	P53265	400 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	NSE5	Q03718	556 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	YDR222W	Q04925	415 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	TAF9	Q05027	157 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	BI2	P03873	423 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	BI4	P03879	638 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	CYC8	P14922	966 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	FHL1	P39521	936 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	AVT2	P39981	480 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	OSW7	P43611	510 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	STU2	P46675	888 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	KAR3	P17119	729 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	RAD16	P31244	790 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	PSY2	P40164	858 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	YGR021W	P53212	290 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.24	■□□□□ 0.51	not detected
SRX1	YKL086W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	RAD59	Q12223	238 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	NDJ1	Q12366	352 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	DSS4	P32601	143 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	PCH2	P38126	564 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.23	■□□□□ 0.51	not detected
SRX1	YKL086W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	HRD3	Q05787	833 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	DAL1	P32375	460 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	YBR225W	P38321	900 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	LSB6	P42951	607 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	SNZ3	P43545	298 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	SNZ2	P53824	298 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	RGR1	P19263	1082 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	PPZ1	P26570	692 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	BCH2	P36122	765 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	JJJ1	P53863	590 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	ALF1	P53904	254 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	CTR9	P89105	1077 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	YMR018W	Q04364	514 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	AIM39	Q08223	395 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	YPQ1	Q12010	308 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SRX1	YKL086W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	SRB2	P34162	210 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	YBR053C	P38235	358 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	YPL062W	Q02781	134 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	YDR344C	Q05510	147 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	DAS2	Q12084	232 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	KEX2	P13134	814 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	BET2	P20133	325 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	RAM1	P22007	431 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	COY1	P34237	679 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	SSP1	P38871	571 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	NUP60	P39705	539 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	YNR014W	P53719	212 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	GYL1	Q04322	720 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	ERV41	Q04651	352 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	PUT4	P15380	627 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	RAD57	P25301	460 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	DUG2	P38149	878 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	PML39	Q03760	334 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	SOV1	Q04748	898 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	THI20	Q08224	551 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	BLI1	P35727	113 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	BSP1	Q06604	576 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	SIL1	Q08199	421 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	PRK1	P40494	810 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	YLR001C	Q07895	862 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	YRR1	Q12172	810 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	VPS5	Q92331	675 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	SEG2	P34250	1132 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	HSL7	P38274	827 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	TMN3	P40071	706 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	ARP7	Q12406	477 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SRX1	YKL086W	ISF1	P32488	338 aa		18.14	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	HSP78	P33416	811 aa		18.14	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	SPC72	P39723	622 aa		18.14	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	YER189W	P40104	122 aa		18.14	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	SAP185	P40856	1058 aa		18.14	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	ERG11	P10614	530 aa		18.13	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	DBF4	P32325	704 aa		18.13	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	HXT1	P32465	570 aa		18.13	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	HIS2	P38635	335 aa		18.13	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	SEC9	P40357	651 aa		18.13	■□□□□ 0.49
SRX1	YKL086W	STE11	P23561	717 aa		18.12	■□□□□ 0.49

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