RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT15	YER148W	POL1	P13382	1468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	DID4	P36108	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	AIM21	P40563	679 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	MSE1	P48525	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	ECM9	Q02202	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	RNT1	Q02555	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	TRM13	Q12383	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	APM4	Q99186	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	HOS4	P40480	1083 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	KIN4	Q01919	800 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	ADY4	Q05955	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	FRE5	Q08908	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	PUS9	Q12069	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	ALG7	P07286	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	SWI6	P09959	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	MRC1	P25588	1096 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YKR075C	P36155	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YHR202W	P38887	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	HXT7	P39004	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	BFA1	P47113	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	HFI1	Q12060	488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	SUL1	P38359	859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	CHS7	P38843	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	SUN4	P53616	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	OAF3	P36023	863 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	LYS9	P38999	446 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	YJL163C	P46996	555 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	EUG1	P32474	517 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	PET127	P32606	800 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	YPT7	P32939	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	BCD1	P38772	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	UBC11	P52492	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	TMA17	Q12513	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	SIR3	P06701	978 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	PEX1	P24004	1043 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	SEC65	P29478	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	YKU70	P32807	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	YBR071W	P38243	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	NUP60	P39705	539 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	FMP52	P40008	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	GET2	P40056	285 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	MTL1	P53214	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	YHM2	Q04013	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	TRE2	Q08693	809 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	STH1	P32597	1359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	FMO1	P38866	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	DAS1	P47005	663 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	NIT2	P47016	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	YAP1802	P53309	568 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	OMS1	Q06668	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	VHS3	Q08438	674 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	IRC13	Q08630	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	STU1	P38198	1513 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	AEP2	P22136	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	HIR1	P32479	840 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	SEC6	P32844	805 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	REV7	P38927	245 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	COX18	P53239	316 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	RIA1	P53893	1110 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	CTF4	Q01454	927 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	THI22	Q06490	572 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	SGO1	Q08490	590 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	RMP1	Q12530	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	USO1	P25386	1790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPT15	YER148W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms