RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data2.99□□□□□ -1.93not detected
GCN4YEL009C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C EMC3P36039 253 aa2.99□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C GMH1P36125 273 aa2.99□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C TAD1P53065 400 aa2.99□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C EAF1Q06337 982 aa2.99□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C EUG1P32474 517 aa2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C UGP1P32861 499 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C SFB3P38810 929 aa2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C FMO1P38866 432 aa2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C SET5P38890 526 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C MTR3P48240 250 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C TAF8Q03750 510 aa2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C ORM2Q06144 216 aa2.98□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C SPE2P21182 396 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C SAT4P25333 603 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C MVD1P32377 396 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C PHO11P35842 467 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C PHO12P38693 467 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C LYS9P38999 446 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C NUP60P39705 539 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C CCT5P40413 562 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C GYP8P43570 497 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C MTL1P53214 551 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C IRC3Q06683 689 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C REH1Q06709 432 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C MLH3Q12083 715 aa2.97□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ARE1P25628 610 aa2.96□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C FUB1P25659 250 aa2.96□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C SAP190P36123 1033 aa2.96□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ZIP2P53061 704 aa2.96□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C YBP2P53169 641 aa2.96□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ERP6P53198 216 aa2.96□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C YBR182C-AQ8TGU6 64 aa2.96□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C APL2P36000 726 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C SPC97P38863 823 aa2.95□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C THR1P17423 357 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C YHR112CP38716 378 aa2.94□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C UBP6P43593 499 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ATG36P46983 293 aa2.94□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C SPO75Q07798 868 aa2.94□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C YOR111WQ99210 232 aa2.94□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C PSK1P31374 1356 aa2.94□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ABF1P14164 731 aa2.93□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C RAD4P14736 754 aa2.93□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ADE2P21264 571 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C TAX4P47030 604 aa2.93□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ARG5,6Q01217 863 aa2.93□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C MCM21Q06675 368 aa2.93□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C MHP1P43638 1398 aa2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C MBR1P23493 339 aa2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C RLP7P40693 322 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C HXT16P47185 567 aa2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C SPC98P53540 846 aa2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ZRT2Q12436 422 aa2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C OSH2Q12451 1283 aa2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C HRP1Q99383 534 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C YML133CQ03099 1374 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C YLL067CQ07888 1374 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C YLL066CQ99208 1374 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C TOM70P07213 617 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C HSP60P19882 572 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C SET3P36124 751 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C BET3P36149 193 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C APT2P36973 181 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C YMC2P38087 329 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C LSC1P53598 329 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ATP25Q03153 612 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C YDR514CQ04408 483 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C ULA1Q12059 462 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C USV1Q12132 391 aa2.91□□□□□ -1.94
GCN4YEL009C DIF1O13577 133 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C CIT1P00890 479 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C STE12P13574 688 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PER1P25625 357 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C HOT13P36078 116 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C SHR5P41912 237 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C TIM54P47045 478 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C YGR125WP53273 1036 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C HMO1Q03973 246 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PDS5Q04264 1277 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C HFD1Q04458 532 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C MET7Q08645 548 aa2.9□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
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