RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W IMD3P50095 523 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ERP6P53198 216 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W OKP1P53298 406 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ADY3Q07732 790 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ESC8Q08119 714 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W CMC2Q3E7A4 109 aa5.34□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SIR4P11978 1358 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RPO26P20435 155 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CNA1P23287 553 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ZIP1P31111 875 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MYO3P36006 1272 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SDS22P36047 338 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RCN1P36054 211 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W BSD2P38356 321 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GYP8P43570 497 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RBG2P53295 368 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W DSE4P53753 1117 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ALD6P54115 500 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TRS120Q04183 1289 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GMC2Q06201 188 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PIG1Q06216 648 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YCG1Q06680 1035 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NDE2Q07500 545 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YRF1-1P0CX20 1796 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YRF1-5P0CX21 1796 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YRF1-8P0CX22 1796 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W DCD1P06773 312 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RDS2P19541 446 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W REC107P21651 314 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W URE2P23202 354 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W KIP1P28742 1111 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TFB1P32776 642 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CHK1P38147 527 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CCZ1P38273 704 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W REV7P38927 245 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W LSB1P53281 241 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W UFD2P54860 961 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W VPS15P22219 1454 aa5.33□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W IPP1P00817 287 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W FUR4P05316 633 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W BIK1P11709 440 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NPP1P25353 742 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SMC1P32908 1225 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GIP1P38229 639 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TOK1P40310 691 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GPD2P41911 440 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YNR063WP53749 607 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MAK10Q02197 733 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NTG2Q08214 380 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SNF1P06782 633 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W OM45P16547 393 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W DPB2P24482 689 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W VMA6P32366 345 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ERT1P38140 529 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SOH1P38633 127 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SAW1P39735 261 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RPH1P39956 796 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W AIM9P40053 627 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W EMP65P40085 556 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YFH7P43591 353 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W KAP114P53067 1004 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RMD1Q03441 430 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GLO2Q05584 274 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MLC2Q06580 163 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TMA16Q08687 178 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MCM16Q12262 181 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RTR2Q12378 196 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SRN2Q99176 213 aa5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W COQ4O13525 335 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W HIS4P00815 799 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TRX1P22217 103 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SUV3P32580 737 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PTC3P34221 468 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MDJ1P35191 511 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YHL050CP38721 697 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YHR219WP38900 624 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W DLD3P39976 496 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W HUL4P40985 892 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W COX16P47081 118 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MDE1P47095 244 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YJR107WP47145 328 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CGR1P53188 120 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TBF1Q02457 562 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W KAP120Q02932 1032 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SAS4Q04003 481 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SGD1Q06132 899 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NSE1Q07913 336 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YPR022CQ12139 1133 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YEL077CQ3E7X8 1277 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PSK1P31374 1356 aa5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 127.7 ms