RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG8	YBL078C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
ATG8	YBL078C	GCN2	P15442	1659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	DIF1	O13577	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	HOP1	P20050	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SPC72	P39723	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	EAF5	P39995	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YKE2	P52553	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	MEH1	Q02205	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	ENT1	Q12518	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	AAC3	P18238	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	PHO3	P24031	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YSC84	P32793	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	NUP120	P35729	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SHR5	P41912	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	MTC3	P53077	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	HOL1	P53389	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	DCS2	Q12123	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	AIM26	P32858	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SAP190	P36123	1033 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	APM3	P38153	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RKM3	P38222	552 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	UBS1	P38290	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SAW1	P39735	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SMK1	P41808	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YFL052W	P43551	465 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MAD3	P47074	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	PCL10	P53124	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SRT1	Q03175	343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RSC58	Q07979	502 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MCH5	Q08777	521 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	ARP7	Q12406	477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	COQ4	O13525	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	FUN30	P31380	1131 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SLC1	P33333	303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	CCZ1	P38273	704 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	BCD1	P38772	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YHR202W	P38887	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	AXL2	P38928	823 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YEL068C	P39977	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RAD26	P40352	1085 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	VID28	P40547	921 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	VMR1	P38735	1592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RAV1	P47104	1357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SNF5	P18480	905 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	HXT4	P32467	576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	PAH1	P32567	862 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	LAM1	P38851	1228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	CEP3	P40969	608 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SGM1	P47166	707 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	YAP1802	P53309	568 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MRPL22	P53881	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	ARA2	Q04212	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SGD1	Q06132	899 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	IML1	P47170	1584 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	PDR11	P40550	1411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	PRC1	P00729	532 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SPS1	P08458	490 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SWI6	P09959	803 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	ADH4	P10127	382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	MRP7	P12687	371 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	PPE1	P38796	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	VHR1	P40522	640 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	BFA1	P47113	574 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG8	YBL078C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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