RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	IL1R1	P14778	569 aa		20.33	■□□□□ 0.85
DDX11-222	ENST00000542777	PRKG1	Q13976	671 aa		20.33	■□□□□ 0.85
DDX11-222	ENST00000542777	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		20.33	■□□□□ 0.85
DDX11-222	ENST00000542777	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		20.33	■□□□□ 0.85
DDX11-222	ENST00000542777		F8W031	263 aa	Predicted RBP	20.31	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	20.31	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		20.31	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	TM4SF4	P48230	202 aa		20.3	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		20.3	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		20.3	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D8	O95759	1140 aa		20.29	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	CFAP100	Q494V2	611 aa		20.29	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	SUCLG2	Q96I99	432 aa		20.29	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	JAG2	Q9Y219	1238 aa		20.29	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	20.29	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		20.28	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	MYO1B	O43795	1136 aa		20.28	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		20.28	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	FZD1	Q9UP38	647 aa		20.28	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	CLRN2	A0PK11	232 aa		20.27	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	UBE4A	Q14139	1066 aa		20.27	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	KAZALD1	Q96I82	304 aa		20.27	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF521	Q96K83	1311 aa		20.27	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		20.26	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	20.26	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	SPDYE6	P0CI01	402 aa		20.26	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	20.26	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	SREBF2	Q12772	1141 aa		20.26	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	20.26	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		20.26	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		20.26	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	20.25	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	GYG1	P46976	350 aa		20.25	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	SPRYD7	Q5W111	196 aa		20.25	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	20.25	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		20.25	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	VEZT	Q9HBM0	779 aa		20.25	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	20.25	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	UTY	O14607	1347 aa		20.25	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	MAP3K11	Q16584	847 aa		20.24	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		20.24	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		20.24	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	GPR25	O00155	361 aa		20.23	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		20.23	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	20.23	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	AOX1	Q06278	1338 aa		20.23	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		20.23	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		20.22	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	20.22	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	20.22	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	20.22	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	20.22	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	SOX10	P56693	466 aa		20.21	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	RASA3	Q14644	834 aa		20.21	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		20.21	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		20.21	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	PTPRC	P08575	1304 aa		20.21	■□□□□ 0.83
DDX11-222	ENST00000542777	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	20.2	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	INHBE	P58166	350 aa		20.2	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC24	Q50LG9	513 aa		20.2	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		20.2	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	WNK4	Q96J92	1243 aa		20.2	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		20.2	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	20.2	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		20.2	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		20.2	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	UNCX	A6NJT0	531 aa		20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777		E9PSI1	815 aa		20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	ALDH1A1	P00352	501 aa		20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	TNFAIP1	Q13829	316 aa		20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	METTL24	Q5JXM2	366 aa		20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	VPS37D	Q86XT2	251 aa		20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	20.19	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	FKTN	O75072	461 aa		20.18	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	20.18	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		20.18	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	20.18	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		20.17	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	CRK	P46108	304 aa		20.17	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		20.17	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	IFNL1	Q8IU54	200 aa		20.17	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	20.16	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	PDE8B	O95263	885 aa		20.16	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	SLFN5	Q08AF3	891 aa		20.16	■□□□□ 0.82
DDX11-222	ENST00000542777	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	20.16	■□□□□ 0.82

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