RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 TSPY26PQ9H489 355 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 TULP2O00295 520 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 VAMP4O75379 141 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 TAX1BP1Q86VP1 789 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 TIGD1Q96MW7 591 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 NINLQ9Y2I6 1382 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 PTPRUQ92729 1446 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 MYOM2P54296 1465 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM37O94972 964 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 NFE2L2Q16236 605 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF394Q53GI3 561 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 TSC1Q92574 1164 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 MPP4Q96JB8 637 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 CASS4Q9NQ75 786 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 LZTS1Q9Y250 596 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 METP08581 1390 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 PIK3C2GO75747 1445 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 CPS1P31327 1500 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHDP01880 384 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 LDHCP07864 332 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 VAMP1P23763 118 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF132P52740 706 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 PAF1Q8N7H5 531 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 IL17RAQ96F46 866 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 LNPKQ9C0E8 428 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC27Q9C0I9 530 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 PPFIA3O75145 1194 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC19A1P41440 591 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 WASHC5Q12768 1159 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 EP400NLQ6ZTU2 488 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFAF2Q8N183 169 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 FRS2Q8WU20 508 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 RMI1Q9H9A7 625 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 USP25Q9UHP3 1055 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 LAMC1P11047 1609 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 ERICH4A6NGS2 130 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 AP1G2O75843 785 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 MSL3P1P0C860 447 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 SKILP12757 684 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 RPIAP49247 311 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNH2Q12809 1159 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 MFSD4BQ5TF39 518 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGEF25Q86VW2 580 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 FMNL3Q8IVF7 1028 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 PPM1EQ8WY54 764 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CEP89Q96ST8 783 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 MUC3BQ9H195 1237 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 FGAP02671 866 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 SESN3P58005 492 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 E2F5Q15329 346 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRYD7Q5W111 196 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CDHR1Q96JP9 859 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 KIF2CQ99661 725 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 MAP10Q9P2G4 905 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 KLF15Q9UIH9 416 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TBX22Q9Y458 520 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 S100BP04271 92 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNA6P17658 529 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF131P52739 623 aa10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms