RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 SSFA2P28290 1259 aa-1.19□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 MMP16P51512 607 aa-1.19□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 DLX5P56178 289 aa-1.19□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 PRSS12P56730 875 aa-1.19□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 TNFRSF17Q02223 184 aa-1.19□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 FHOD3Q2V2M9 1422 aa-1.19□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 M0R2T5 61 aa-1.21□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 TNFRSF1BP20333 461 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 CCKBRP32239 447 aa-1.21□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 SQSTM1Q13501 440 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 SS18Q15532 418 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 MAP7D1Q3KQU3 841 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 KCTD8Q6ZWB6 473 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 GCC1Q96CN9 775 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 NABP2Q9BQ15 211 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM7Q9C029 511 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa-1.21□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 TCF19Q9Y242 345 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 CSADQ9Y600 493 aa-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 ERVV-2B6SEH9 535 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 CSPG5O95196 566 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 NFATC1O95644 943 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 FGAP02671 866 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 TYRP14679 529 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 C1QTNF8P60827 252 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC41Q15345 812 aa-1.22□□□□□ -2.6
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