RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 ANTXR2P58335 489 aa18.78■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 PRC1O43663 620 aa18.78■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 KCNF1Q9H3M0 494 aa18.78■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 ADD2P35612 726 aa18.77■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 GUCY1B3Q02153 619 aa18.77■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.77■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.77■□□□□ 0.6
SHQ1-202ENST00000444040 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.77■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 NCOA7Q8NI08 942 aa18.77■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.77■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 CNNM1Q9NRU3 951 aa18.77■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.77■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF213O14771 459 aa18.76■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 PDE8BO95263 885 aa18.76■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 TPM3P06753 285 aa18.76■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ATRNO75882 1429 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 PDE8AO60658 829 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ENGASEQ8NFI3 743 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 NBPF3Q9H094 633 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 UQCRHP07919 91 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF165P49910 485 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 SPC24Q8NBT2 197 aa18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.74■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.74■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 MYH7P12883 1935 aa18.74■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA1524Q8TCG1 905 aa18.74■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 CTAGE5O15320 804 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 CAVIN2O95810 425 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 UBE3CQ15386 1083 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC102BQ68D86 513 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 PHKA1P46020 1223 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 MYH3P11055 1940 aa18.73■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 FAM160A1Q05DH4 1040 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 NKX2-3Q8TAU0 364 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 SLIT2O94813 1529 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 NUP98P52948 1817 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 EXOC5O00471 708 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 FGFR2P21802 821 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 IQCB1Q15051 598 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 LRP5O75197 1615 aa18.72■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF75DP51815 510 aa18.71■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 C8orf76Q96K31 380 aa18.71■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.71■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.71■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ME1P48163 572 aa18.71■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.71■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.71■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 IDH1O75874 414 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 PDE6AP16499 860 aa18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 ADALQ6DHV7 355 aa18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 FSIP1Q8NA03 581 aa18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 LPIN2Q92539 896 aa18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 PLCH1Q4KWH8 1693 aa18.7■□□□□ 0.58
SHQ1-202ENST00000444040 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms