RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRC-202ENST00000367364 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRC-202ENST00000367364 LCE4AQ5TA78 99 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRC-202ENST00000367364 A6NHS1 94 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-202ENST00000367364 USP11P51784 963 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRC-202ENST00000367364 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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PTPRC-202ENST00000367364 EREGO14944 169 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
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