RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 DLGAP5Q15398 846 aa23.58■■□□□ 1.37
MALSU1-201ENST00000287543 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.58■■□□□ 1.37
MALSU1-201ENST00000287543 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.58■■□□□ 1.37
MALSU1-201ENST00000287543 LPIN2Q92539 896 aa23.58■■□□□ 1.37
MALSU1-201ENST00000287543 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
MALSU1-201ENST00000287543 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.58■■□□□ 1.37
MALSU1-201ENST00000287543 SCN9AQ15858 1988 aa23.58■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 GNAI2P04899 355 aa23.57■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 SLC5A1P13866 664 aa23.57■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 CERS5Q8N5B7 392 aa23.57■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 AIDAQ96BJ3 306 aa23.57■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 COPRSQ9NQ92 184 aa23.57■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 FGFR2P21802 821 aa23.56■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 MAP2K2P36507 400 aa23.56■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 MTX1Q13505 466 aa23.56■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.56■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.56■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 CDCA5Q96FF9 252 aa23.56■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 SPEF2Q9C093 1822 aa23.56■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 MYO1BO43795 1136 aa23.55■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 HUNKP57058 714 aa23.55■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 FKBP1BP68106 108 aa23.55■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.55■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.55■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.55■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 SIL1Q9H173 461 aa23.54■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 SRGAP3O43295 1099 aa23.53■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.53■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 WBP1LQ9NX94 342 aa23.53■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 F8W031 263 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 NF2P35240 595 aa23.52■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 CFAP100Q494V2 611 aa23.52■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 DLK2Q6UY11 383 aa23.52■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC102AQ96A19 550 aa23.52■■□□□ 1.36
MALSU1-201ENST00000287543 MS4A1P11836 297 aa23.51■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 BCAMP50895 628 aa23.51■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 GRM1Q13255 1194 aa23.51■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.51■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.51■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 JAG2Q9Y219 1238 aa23.51■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.51■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.5■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 SPDYE6P0CI01 402 aa23.5■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 NOGQ13253 232 aa23.5■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 ATP2B3Q16720 1220 aa23.5■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 RGMBQ6NW40 437 aa23.5■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 TNNQ9UQP3 1299 aa23.5■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 PSME4Q14997 1843 aa23.49■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.49■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.49■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.48■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 MRIQ9BWK5 157 aa23.48■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 ZBTB22O15209 634 aa23.47■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 SEMA3EO15041 775 aa23.46■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 MAST3O60307 1309 aa23.46■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.46■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.46■■□□□ 1.35
MALSU1-201ENST00000287543 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 FOXN1O15353 648 aa23.45■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 CA12O43570 354 aa23.45■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 TNFAIP1Q13829 316 aa23.45■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 AOC2O75106 756 aa23.44■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 CRKP46108 304 aa23.44■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.44■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.44■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.44■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.43■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.43■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 TEKT1Q969V4 418 aa23.43■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.43■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 CLRN2A0PK11 232 aa23.42■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 ATP8B2P98198 1209 aa23.42■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 VEZTQ9HBM0 779 aa23.42■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.41■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.41■■□□□ 1.34
MALSU1-201ENST00000287543 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 202.3 ms