RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YEL077W-AP0CX95 160 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR296C-BP0CX96 160 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL283W-BP0CX97 160 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR204C-AP0CX98 160 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APL3P38065 1025 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YEL076CP39971 216 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGL117WP53133 265 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDL086WQ07505 273 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GPR1Q12361 961 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 WHI5Q12416 295 aa0.84□□□□□ -2.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRC1P00729 532 aa0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCP4P25349 247 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AAR2P32357 355 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIM1P40472 476 aa0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL024CP40543 189 aa0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRP31P49704 494 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DMA2P53924 522 aa0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NGL2Q03264 515 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS16Q03308 798 aa0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSC6Q08818 692 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DUT1P33317 147 aa0.82□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPL4P36517 319 aa0.82□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHR097CP38809 366 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VRG4P40107 337 aa0.82□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MDV1P47025 714 aa0.82□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CPR8P53728 308 aa0.82□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR179W-AQ03983 463 aa0.82□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AIM44Q99299 758 aa0.82□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HEM1P09950 548 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TOP3P13099 656 aa0.81□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCR043CP25361 127 aa0.81□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPC34P32910 317 aa0.81□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHR112CP38716 378 aa0.81□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CFD1P40558 293 aa0.81□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIR016WP40572 265 aa0.81□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NOG2P53742 486 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ESC2Q06340 456 aa0.81□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data0.81□□□□□ -2.28not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR085WP0CF18 432 aa0.8□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ABD1P32783 436 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 REC104P33323 182 aa0.8□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HSL7P38274 827 aa0.8□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TES1P41903 349 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KRI1P42846 591 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HRP1Q99383 534 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRD1P09007 221 aa0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PMA2P19657 947 aa0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MCM2P29469 868 aa0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APL2P36000 726 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APT2P36973 181 aa0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIT1P39980 628 aa0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OPT1P40897 799 aa0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BST1P43571 1029 aa0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ROK1P45818 564 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HOS2P53096 452 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ESF1Q06344 628 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBX3Q12229 455 aa0.79□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LEU2P04173 364 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AQY1P0CD91 305 aa0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC34P14682 295 aa0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRP28P23394 588 aa0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERG6P25087 383 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TOK1P40310 691 aa0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IMP4P53941 290 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LCD1Q04377 747 aa0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BSP1Q06604 576 aa0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IZH3Q07959 543 aa0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RKI1Q12189 258 aa0.78□□□□□ -2.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPT1P01123 206 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADE2P21264 571 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AIM17P23180 465 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEX1P24004 1043 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PPZ1P26570 692 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERT1P38140 529 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STM1P39015 273 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YEL068CP39977 110 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL152WP40455 235 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MKT1P40850 830 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SAD1P43589 448 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJL043WP47053 257 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TPO2P53283 614 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DIP5P53388 608 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 THI21Q08975 551 aa0.77□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DAL7P21826 554 aa0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BCS1P32839 456 aa0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CTP1P38152 299 aa0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RIM4P38741 713 aa0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MET10P39692 1035 aa0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PIG2P40187 538 aa0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COP1P53622 1201 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARG5,6Q01217 863 aa0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUL2Q03758 920 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DSE3Q08729 430 aa0.76□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERG20P08524 352 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAD18P10862 487 aa0.75□□□□□ -2.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SBA1P28707 216 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 67.5 ms