RNA–Protein interactions for RNA: YOR179C

SYC1, Transcript of Subunit of the APT subcomplex of cleavage and polyadenylation factor, yeast

Gene SYC1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYC1	YOR179C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	YHR112C	P38716	378 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	PEA2	P40091	420 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	TPM2	P40414	161 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	TAF1	P46677	1066 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	DAS1	P47005	663 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	COX18	P53239	316 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	MCM21	Q06675	368 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	ENB1	Q08299	606 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	SGO1	Q08490	590 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	TGL5	Q12043	749 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	LAS17	Q12446	633 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	YKU70	P32807	602 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	THI80	P35202	319 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	ECM1	P39715	212 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	EMP65	P40085	556 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	GID8	P40208	455 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	VID28	P40547	921 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	REC102	Q02721	264 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	GAD1	Q04792	585 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	VHS3	Q08438	674 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	NYV1	Q12255	253 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	HIR1	P32479	840 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	DUN1	P39009	513 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	YNL195C	P40168	261 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	YPS7	Q06325	596 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	PEX15	Q08215	383 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
SYC1	YOR179C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	ATP12	P22135	325 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
SYC1	YOR179C	ERG5	P54781	538 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	PET127	P32606	800 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	NIC96	P34077	839 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	GIP4	P39732	760 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	VPS36	Q06696	566 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	ECM3	Q99252	613 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	ATP4	P05626	244 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	MET3	P08536	511 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	CDC26	P14724	124 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	DCG1	P32460	244 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	IES1	P43579	692 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	MUP1	P50276	574 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	MTL1	P53214	551 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	DLT1	Q04216	342 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	STP4	Q07351	490 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYC1	YOR179C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	DGR2	P32330	852 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	HXT4	P32467	576 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	ELO3	P40319	345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YIR042C	P40586	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	AMA1	P50082	593 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PHO23	P50947	330 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	HOL1	P53389	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	MET14	Q02196	202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	IME1	P21190	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	GET2	P40056	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PXA1	P41909	870 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	BUL1	P48524	976 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	GAL1	P04385	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	HCM1	P25364	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	KCC4	P25389	1037 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	CTS1	P29029	562 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YBR053C	P38235	358 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YHR033W	P38690	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	LYS9	P38999	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	EAF5	P39995	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	BUD8	P41698	603 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	BIT61	P47041	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms