RNA–Protein interactions for RNA: YNL035C

YNL035C, Transcript of Nuclear protein of unknown function, yeast

Gene YNL035C, Length 1,170 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL035C	YNL035C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	KAR4	P25583	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	SIC1	P38634	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	RPP1	P38786	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	DUN1	P39009	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	COX18	P53239	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	NRG1	Q03125	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YPS7	Q06325	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	CDC26	P14724	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YNL195C	P40168	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	MRPS35	P53292	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	VHS3	Q08438	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	SGO1	Q08490	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	SOD2	P00447	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	PTP2	P29461	750 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	HXT4	P32467	576 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YKL133C	P36066	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	APT2	P36973	181 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	FUI1	P38196	639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YBR259W	P38338	688 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	YHR112C	P38716	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	EAF5	P39995	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	EXG2	P52911	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	TMA10	Q06177	86 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	MLC2	Q06580	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	OMS1	Q06668	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	TGL5	Q12043	749 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	TRM11	Q12463	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL035C	YNL035C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	TOD6	P34219	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	CTF13	P35203	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	YKL222C	P35995	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	RIM4	P38741	713 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	GID8	P40208	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	HIS6	P40545	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	FKH2	P41813	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	IES1	P43579	692 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	HOL1	P53389	586 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	UBX4	P54730	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	REC102	Q02721	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	ATG16	Q03818	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	MCM21	Q06675	368 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	STP4	Q07351	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	DGR2	P32330	852 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	LST4	P34239	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	YIL092W	P40497	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	RIM8	P53179	542 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	GAD1	Q04792	585 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	VPS36	Q06696	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	ESC8	Q08119	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	NUR1	Q12066	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	ECM3	Q99252	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	YCR015C	P25616	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	PET127	P32606	800 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	KTR4	P38131	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	IME1	P21190	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	THI80	P35202	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	YHR033W	P38690	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	YHL041W	P38730	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	ECM1	P39715	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	YEL076C	P39971	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	BUD8	P41698	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	IRC5	P43610	853 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	LAS17	Q12446	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	PHO3	P24031	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL035C	YNL035C	SAW1	P39735	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.6 ms