RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	REC107	P21651	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	REC104	P33323	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SLC1	P33333	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SET3	P36124	751 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YBR138C	P38277	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	MSN5	P52918	1224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	PPT1	P53043	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	MET17	P06106	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	CKA1	P15790	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	PHO3	P24031	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	ROX1	P25042	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	CTF18	P49956	741 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SGF29	P25554	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	TFB1	P32776	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	HSL7	P38274	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YLF2	P38746	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SHU2	P38957	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	IRC5	P43610	853 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YJR124C	P47159	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	ZIP2	P53061	704 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	GYP1	Q08484	637 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	CIR2	Q08822	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	CMP2	P14747	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
STV1	YMR054W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	VNX1	P42839	908 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YKE2	P52553	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	CBK1	P53894	756 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RKM2	Q03942	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	ARP9	Q05123	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	NUP170	P38181	1502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SEC61	P32915	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YJL068C	P40363	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	GCD10	P41814	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SKP2	P42843	763 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	GUP1	P53154	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	ALF1	P53904	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	EAR1	Q03212	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	PMS1	P14242	873 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SEC65	P29478	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	HXT4	P32467	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	NGG1	P32494	702 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YKR051W	P36142	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SWD1	P39706	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	FMP10	P40098	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	NAS2	P40555	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	LYS14	P40971	790 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	DAM1	P53267	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SNO4	Q04902	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	HSP32	Q08992	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SPO14	P36126	1683 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YCL002C	P25565	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	UGA3	P26370	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	POL31	P46957	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YJR098C	P47139	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	ARP4	P80428	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	MRP10	O75012	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	ADE8	P04161	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	APE1	P14904	514 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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