RNA–Protein interactions for RNA: YJL110C

GZF3, Transcript of GATA zinc finger protein, yeast

Gene GZF3, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GZF3	YJL110C	DUS4	Q06063	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SWM1	Q12379	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	RTP1	Q12751	981 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	HOP1	P20050	605 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	MSH1	P25846	959 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	JNM1	P36224	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	CHA4	P43634	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SPT20	P50875	604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	ORC4	P54791	529 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	YAP6	Q03935	383 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	OPY2	Q06810	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
GZF3	YJL110C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	CDC6	P09119	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	MSM1	P22438	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	MNN4	P36044	1178 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	YKR075C	P36155	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	NCS6	P53088	359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	YBP2	P53169	641 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	NPC2	Q12408	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	STE14	P32584	239 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SDS22	P36047	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SAW1	P39735	261 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	ASK10	P48361	1146 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	TEP1	P53916	434 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	PKH1	Q03407	766 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SOD2	P00447	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	INH1	P01097	85 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	VHR1	P40522	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	MDG1	P53885	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	ASI2	P53895	289 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	BLS1	Q06071	122 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SSP2	Q08646	371 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SSM4	P40318	1319 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	RER1	P25560	188 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	CDC20	P26309	610 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	CHS3	P29465	1165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	ELM1	P32801	640 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SEG2	P34250	1132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	TMA108	P40462	946 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	PFA3	P42836	336 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	AVT1	P47082	602 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	RIM8	P53179	542 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	DCS2	Q12123	353 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GZF3	YJL110C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	FAT1	P38225	669 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	PPE1	P38796	400 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	MNT3	P40549	630 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	IRC24	P40580	263 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	UBA2	P52488	636 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	HIM1	Q06674	414 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	PEX19	Q07418	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	SWI6	P09959	803 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	MCM10	P32354	571 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	APT2	P36973	181 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	PSY4	P38193	441 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	PLB1	P39105	664 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	SRB7	P47822	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	ARP7	Q12406	477 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	ATP12	P22135	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	PHO3	P24031	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	BEM3	P32873	1128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	RAD26	P40352	1085 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	YIL092W	P40497	633 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	HLR1	Q04429	423 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	NUR1	Q12066	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GZF3	YJL110C	YLR415C	O13578	112 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.3 ms