RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT15	YER148W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	YBR259W	P38338	688 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	GIP4	P39732	760 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	UME1	Q03010	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	VTH1	P40438	1549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	VTH2	P40890	1549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	CKB2	P38930	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	ORC4	P54791	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	ASM4	Q05166	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	PDR10	P51533	1564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	GRX4	P32642	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	YJR096W	P47137	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	PHO23	P50947	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	GPG1	P53130	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	YBP2	P53169	641 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	NRG1	Q03125	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	NUP145	P49687	1317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
SPT15	YER148W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	TRM2	P33753	639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	GID8	P40208	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	RET2	P43621	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	YGR237C	P50089	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	MRPS35	P53292	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	YKL222C	P35995	705 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	KTR4	P38131	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	AMA1	P50082	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	ARP4	P80428	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	HFD1	Q04458	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	MCM21	Q06675	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	AIM39	Q08223	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	DCS2	Q12123	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	MYO4	P32492	1471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	MET3	P08536	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	MNN4	P36044	1178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	MAL31	P38156	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	FKH2	P41813	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	MAK10	Q02197	733 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	DLT1	Q04216	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	TGL5	Q12043	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPT15	YER148W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	ERG4	P25340	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	ELO3	P40319	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YIR042C	P40586	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	TSR4	P25040	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	APT2	P36973	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YAP3	P38749	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	TDA3	P38758	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	BEM4	P39011	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YEN1	P40028	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	BAP3	P41815	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	REC102	Q02721	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	GAD1	Q04792	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	BUD3	P25558	1636 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	BNR1	P40450	1375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YOR1	P53049	1477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	APN2	P38207	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YBR053C	P38235	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	PAF1	P38351	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YHR112C	P38716	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	YGR153W	P48238	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPT15	YER148W	MUP1	P50276	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.9 ms