RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG8	YBL078C	CIA1	Q05583	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	MED1	Q12321	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	BI4	P03879	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	OPI1	P21957	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	PTC7	P38797	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	ALY2	P47029	1046 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	VPS53	P47061	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	SRB7	P47822	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	NIT3	P49954	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	MSM1	P22438	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	RNQ1	P25367	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	SLA2	P33338	968 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	TFC3	P34111	1160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YFL054C	P43549	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	HIF1	Q12373	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	FAT1	P38225	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YHL012W	P38709	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	NPP2	P39997	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	GTS1	P40956	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	HXT16	P47185	567 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	BLS1	Q06071	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	OPY2	Q06810	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	ACM1	Q08981	209 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	HFI1	Q12060	488 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	DAL7	P21826	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	ATP12	P22135	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YCL002C	P25565	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SWI3	P32591	825 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	OAF3	P36023	863 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	PSY4	P38193	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	HSL7	P38274	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YAP3	P38749	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	VPS8	P39702	1274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	BNA2	P47125	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	TEP1	P53916	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SAM35	P14693	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SAN1	P22470	610 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	MSH1	P25846	959 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	IMP2'	P32351	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	MDL2	P33311	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	UGA2	P38067	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	UBP5	P39944	805 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	VTC2	P43585	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YJL045W	P47052	634 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	ASK10	P48361	1146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	GYP7	P48365	746 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	ENV11	P53246	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	OMS1	Q06668	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	NUR1	Q12066	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	HOM3	P10869	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	RER1	P25560	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SEC65	P29478	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	RRN3	P36070	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YKR051W	P36142	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YER158C	P40095	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	RSC1	P53236	928 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SFB2	P53953	876 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SPC19	Q03954	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	GRC3	Q07845	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	MDM38	Q08179	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	APM4	Q99186	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	GIC1	P38785	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	YIL092W	P40497	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	HLR1	Q04429	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	CRR1	Q05790	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	CDA2	Q06703	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG8	YBL078C	SDH5	Q08230	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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