RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591994.1

RPRD1A-210, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 2

Gene RPRD1A, Length 2,484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-210	ENST00000591994	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994		H3BRJ5	948 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ATP11A	P98196	1134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	EHHADH	Q08426	723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	CES1	P23141	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	USP5	P45974	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	PAX4	O43316	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	CD97	P48960	835 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	EDEM1	Q92611	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	TM4SF5	O14894	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZBTB39	O15060	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	PDGFA	P04085	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	TXK	P42681	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	NFIA	Q12857	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	FAM13A	O94988	1023 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	EDN3	P14138	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	NPR3	P17342	541 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68	2e-6	■■□□□ 13.7
RPRD1A-210	ENST00000591994	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	EPHA1	P21709	976 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	SSTR4	P31391	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-210	ENST00000591994	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	WISP1	O95388	367 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	NEFL	P07196	543 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	IRAK1	P51617	712 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	NFKBIE	O00221	500 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	PHACTR2	O75167	634 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPRD1A-210	ENST00000591994	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms