RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akt1s1Q9D1F4 257 aa14.96□□□□□ -0.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sept12Q9D451 317 aa14.96□□□□□ -0.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gja10Q9WUS4 505 aa14.96□□□□□ -0.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mx2Q9WVP9 655 aa14.96□□□□□ -0.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa14.96□□□□□ -0.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Casp1P29452 402 aa14.96□□□□□ -0.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp51Q3U4L8 781 aa14.96□□□□□ -0.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf496Q5SXI5 585 aa14.96□□□□□ -0.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxo3Q9WVH4 672 aa14.96□□□□□ -0.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C4bP01029 1738 aa14.96□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cavin1O54724 392 aa14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pram1Q6BCL1 675 aa14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekho1Q9JIY0 408 aa14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EvplQ9D952 2035 aa14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syt1P46096 421 aa14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpatch11Q3UFS4 262 aa14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr93Q402B2 695 aa14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nphp3Q7TNH6 1325 aa14.95□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IntuQ059U7 942 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp9aQ66X03 949 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan22Q8BGS5 496 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mb21d2Q8C525 428 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc178Q8CDV0 866 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr78E9PYY5 807 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd22P35329 862 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp91Q62511 572 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msl1Q6PDM1 616 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps6ka5Q8C050 863 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lgr5Q9Z1P4 907 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptgs1P22437 602 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hvcn1Q3U2S8 269 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrfip2Q91WK0 415 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Emilin1Q99K41 1017 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Add2Q9QYB8 725 aa14.94□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc173A0JLY1 547 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfap73J3QPZ5 306 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kank4Q6P9J5 1016 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx13Q6PHS6 957 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubxn10Q8BG34 277 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sumf1Q8R0F3 372 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700029H14RikE9PY36 240 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sept1P42209 366 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2hP62257 183 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arid3aQ62431 601 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr24Q8CFJ9 790 aa14.93□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CgnP59242 1191 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhf1Q3TB82 279 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr3gQ6NXY9 223 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tti2Q8BGV4 512 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tsr2Q8C8T8 191 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amhr2Q8K592 568 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CpzQ8R4V4 654 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl7a2O54831 253 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Npy5rO70342 466 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmod1Q8BVA4 595 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nek11Q8C0Q4 628 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmel1Q9JLI3 765 aa14.92□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snapc4Q8BP86 1333 aa14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Celf1P28659 486 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtkn2Q14B46 604 aa14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plbd2Q3TCN2 594 aa14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pim2Q62070 370 aa14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc66Q6NS45 935 aa14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rdm1Q9CQK3 281 aa14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr29B1ARI9 187 aa14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hand2Q61039 217 aa14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Edrf1Q6GQV7 1239 aa14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam184aE9PW83 1143 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmod3E9QA62 571 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g4fQ50L41 855 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map10Q8BJS7 891 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Inpp5bQ8K337 993 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D9S1 216 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpf1Q9QX66 387 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plch1Q4KWH5 1682 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ric1Q69ZJ7 1422 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgsm2Q80U12 1005 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ift57Q8BXG3 429 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erc1Q99MI1 1120 aa14.9□□□□□ -0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MsnP26041 577 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.6 ms