RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-208	ENST00000392449	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19	1e-6	■■□□□ 12.4
PTPRK-208	ENST00000392449	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	LCAT	P04180	440 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ATP6V1B2	P21281	511 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PAX2	Q02962	417 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TSPAN31	Q12999	210 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	AWAT1	Q58HT5	328 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MRI1	Q9BV20	369 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM100	Q9NV29	134 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MPPED2	Q15777	294 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449		A0A1B0GWJ7	208 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	BHLHE40	O14503	412 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	EGR1	P18146	543 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	IFNGR2	P38484	337 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	GNB2	P62879	340 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PAX8	Q06710	450 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	DOK3	Q7L591	496 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	DDO	Q99489	341 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449		M0R135	149 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM20B	O75063	409 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	GYPB	P06028	91 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	CA6	P23280	308 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	GNGT1	P63211	74 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MXRA7	P84157	204 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF92	Q03936	586 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PGAP1	Q75T13	922 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF799	Q96GE5	643 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	IFNL4	K9M1U5	179 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TNFRSF11B	O00300	401 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	IDH3B	O43837	385 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	GAST	P01350	101 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	CLU	P10909	449 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC2A1	P11166	492 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF823	P16415	610 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	RAD23A	P54725	363 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TPTE	P56180	551 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ECH1	Q13011	328 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MALL	Q13021	153 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MIOX	Q9UGB7	285 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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