RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PCBD1	P61457	104 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PSG7	Q13046	419 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	SCARB2	Q14108	478 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	SMYD1	Q8NB12	490 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	DYRK2	Q92630	601 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	CLN8	Q9UBY8	286 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	HAO1	Q9UJM8	370 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		9.03	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	GMNC	A6NCL1	334 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC30	A6NM36	301 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPBD1	B2RD01	187 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNL4	K9M1U5	179 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	UBD	O15205	165 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR137B	O60478	399 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	TPST2	O60704	377 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	THRB	P10828	461 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	PITPNB	P48739	271 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	BST1	Q10588	318 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST3H3	Q16695	136 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT71	Q3SY84	523 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf128	Q5T292	105 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF774	Q6NX45	483 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01006	Q8NI28	216 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB10	Q8WXI3	467 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2H4	Q92759	462 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	INIP	Q9NRY2	104 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		9.02	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPL8	197 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511		G3V4G9	280 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	CLPX	O76031	633 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	IRF2	P14316	349 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	LAP3	P28838	519 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	STX1B	P61266	288 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	PAX2	Q02962	417 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	FMOD	Q06828	376 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM189A2	Q15884	450 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM27B	Q5VT28	67 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	PTOV1	Q86YD1	416 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5AS1	Q8N127	324 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRB2	Q8N423	598 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	DTX3	Q8N9I9	347 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	CMBL	Q96DG6	245 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	RBP7	Q96R05	134 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM15	Q9C019	465 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPH	Q9H3R5	247 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM165	Q9HC07	324 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		9.01	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD17	A6NE02	478 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	EVPLL	A8MZ36	301 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RY10	O00398	339 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	OPN1SW	P03999	348 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	CST2	P09228	141 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP2	P41181	271 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR5A	P47898	357 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT2B15	P54855	530 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	PROK1	P58294	105 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		9	□□□□□ -0.97
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZR03	302 aa		9	□□□□□ -0.97

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