RNA–Protein interactions for RNA: YMR183C

SSO2, Transcript of Plasma membrane t-SNARE, yeast

Gene SSO2, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSO2	YMR183C	COG4	Q06096	861 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	MET7	Q08645	548 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	SLX4	Q12098	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	NYV1	Q12255	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	ALG7	P07286	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	MET3	P08536	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	NGG1	P32494	702 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	SPC29	P33419	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	RPP1	P38786	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	TFB2	Q02939	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	PKH1	Q03407	766 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	ATG16	Q03818	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	DLT1	Q04216	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	THI21	Q08975	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	TRM13	Q12383	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	NUP145	P49687	1317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	SAK1	P38990	1142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	ELO3	P40319	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	SNM1	P40993	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	SSY5	P47002	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YJR120W	P47157	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	ENT2	Q05785	613 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	RSC3	Q06639	885 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	GDH3	P39708	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	FKH2	P41813	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	PMT3	P47190	753 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	MRPS35	P53292	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	SND1	Q04007	877 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	OMS1	Q06668	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	YLR415C	O13578	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	ATP4	P05626	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	RPN12	P32496	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	PFA3	P42836	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	HXT16	P47185	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	FRE5	Q08908	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	ACF2	Q12168	779 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	DIF1	O13577	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	HIR1	P32479	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	MNN4	P36044	1178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	SHR5	P41912	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	MUP1	P50276	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	UBA2	P52488	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	YGR021W	P53212	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	NRG1	Q03125	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	UGO1	Q03327	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	PER1	P25625	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	MTC2	P34246	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	AMA1	P50082	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	STB4	P50104	949 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	ZIP2	P53061	704 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	TIM44	Q01852	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	UME1	Q03010	460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	ADY4	Q05955	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	MCH5	Q08777	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	GPR1	Q12361	961 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	PEX6	P33760	1030 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	ALY2	P47029	1046 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	MAL11	P53048	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	THI73	Q07904	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	YBR053C	P38235	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	SIC1	P38634	284 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	YIR042C	P40586	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	IES1	P43579	692 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	PEX14	P53112	341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	MUK1	Q02866	612 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	TMN2	Q04562	672 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSO2	YMR183C	PPS1	P38148	807 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	YBR259W	P38338	688 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	IES5	P40060	125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	PEA2	P40091	420 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	YJL163C	P46996	555 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	YNL193W	P53870	558 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	UBX4	P54730	416 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	TGL5	Q12043	749 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	MDM12	Q92328	271 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	MPD2	Q99316	277 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	PIF1	P07271	859 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSO2	YMR183C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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