RNA–Protein interactions for RNA: YMR093W

UTP15, Transcript of Nucleolar protein, yeastyeast

Gene UTP15, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UTP15YMR093W SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W PRP4P20053 465 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W MAL31P38156 614 aa3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W SIC1P38634 284 aa3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W TDA3P38758 523 aa3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W RPP1P38786 293 aa3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W ECM1P39715 212 aa3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W RET2P43621 546 aa3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W BFA1P47113 574 aa3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W NRG1Q03125 231 aa3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W GPR1Q12361 961 aa3.7□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W HCM1P25364 564 aa3.69□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W CTS1P29029 562 aa3.69□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W APT2P36973 181 aa3.69□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W GZF3P42944 551 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W GPG1P53130 126 aa3.69□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W ESC8Q08119 714 aa3.69□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W MNN4P36044 1178 aa3.68□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W SHM2P37291 469 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W GPP1P41277 250 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W YJR039WP47107 1121 aa3.68□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W YGR153WP48238 217 aa3.68□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W ASM4Q05166 528 aa3.68□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W SGS1P35187 1447 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W MET3P08536 511 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W MRC1P25588 1096 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W DID4P36108 232 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W YKR075CP36155 307 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W PAF1P38351 445 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W CCT5P40413 562 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W AMA1P50082 593 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W ERG5P54781 538 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W MCM21Q06675 368 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W AIM39Q08223 395 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W NTO1Q12311 748 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W LAS17Q12446 633 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W ATG11Q12527 1178 aa3.67□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W KTR4P38131 464 aa3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W APN2P38207 520 aa3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W FKH2P41813 862 aa3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W ARG5,6Q01217 863 aa3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W REC102Q02721 264 aa3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W DLT1Q04216 342 aa3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W GAD1Q04792 585 aa3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W DCS2Q12123 353 aa3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W SSN2P38931 1420 aa3.66□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W PMI40P29952 429 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W GIP4P39732 760 aa3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W GID8P40208 455 aa3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W YIR042CP40586 236 aa3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W SET2P46995 733 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W ARP4P80428 489 aa3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W TGL5Q12043 749 aa3.65□□□□□ -1.82
UTP15YMR093W HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W TRM2P33753 639 aa3.65□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W ELO3P40319 345 aa3.65□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W PHO23P50947 330 aa3.65□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W ECM9Q02202 377 aa3.65□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W TRE2Q08693 809 aa3.65□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W TMA17Q12513 150 aa3.65□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W LAT1P12695 482 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W ERG4P25340 473 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W YCR015CP25616 317 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W EUG1P32474 517 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W TOM20P35180 183 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W YHR202WP38887 602 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W BEM4P39011 633 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W TAF1P46677 1066 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W BUL1P48524 976 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W MUP1P50276 574 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W MRPS35P53292 345 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W TEX1P53851 422 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W APM4Q99186 491 aa3.64□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W YKL222CP35995 705 aa3.63□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W YBR071WP38243 211 aa3.63□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W YHR112CP38716 378 aa3.63□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W RNT1Q02555 471 aa3.63□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W YMR210WQ03649 449 aa3.63□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W YHM2Q04013 314 aa3.63□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W HFI1Q12060 488 aa3.63□□□□□ -1.83
UTP15YMR093W RMP1Q12530 201 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.2 ms