RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	YKU80	Q04437	629 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SPC2	Q04969	178 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ARP9	Q05123	467 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ATG17	Q06410	417 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MET7	Q08645	548 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RSR1	P13856	272 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RAD53	P22216	821 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ITR2	P30606	609 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SMI1	P32566	505 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	UTR2	P32623	467 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NTH2	P35172	780 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	IPL1	P38991	367 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	DSS1	P39112	969 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	AGE2	P40529	298 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	FOL1	P53848	824 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	VPS16	Q03308	798 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.79	□□□□□ -1.48	not detected
VBA1	YMR088C	APC11	Q12157	165 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RAS1	P01119	309 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	REP1	P03871	373 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MSH2	P25847	964 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SSH4	P32343	579 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ALG3	P38179	458 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NUP60	P39705	539 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	JEM1	P40358	645 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PCI8	P40512	444 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	EPL1	P43572	832 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	CLA4	P48562	842 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SRC1	Q03707	834 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NSE5	Q03718	556 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YLR287C	Q05881	355 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SEC10	Q06245	871 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.79	□□□□□ -1.48	not detected
VBA1	YMR088C	VHS3	Q08438	674 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	REX3	Q12090	404 aa		5.79	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NMT1	P14743	455 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ZIM17	P42844	174 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	CNN1	P43618	361 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	VPS53	P47061	822 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	COG2	P53271	262 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YPL109C	Q02981	657 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	TLG2	Q08144	397 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ATP16	Q12165	160 aa		5.78	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	DRS2	P39524	1355 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	STE3	P06783	470 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SWI5	P08153	709 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	PUT4	P15380	627 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SFL1	P20134	766 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	NPP1	P25353	742 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	MCM2	P29469	868 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	YME1	P32795	747 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	MRP4	P32902	394 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	ALG14	P38242	237 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	FZO1	P38297	855 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	RCY1	P39531	840 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	PSY2	P40164	858 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SPO22	P40511	975 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	NEO1	P40527	1151 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	HUL4	P40985	892 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	ABM1	P47146	123 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SIW14	P53965	281 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	DFG5	Q05031	458 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	PNP1	Q05788	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	PUN1	Q06991	263 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	MET32	Q12041	191 aa		5.77	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	CTT1	P06115	562 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SRS2	P12954	1174 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	DBF2	P22204	572 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	DAL1	P32375	460 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	DOA4	P32571	926 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SMF2	P38778	549 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	YHR219W	P38900	624 aa		5.76	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.1 ms