RNA–Protein interactions for RNA: YML054C-A

YML054C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YML054C-A, Length 159 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML054C-AYML054C-A ECM1P39715 212 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A CEP3P40969 608 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A ASN1P49089 572 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PIP2P52960 996 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A TYW3P53177 273 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SPC98P53540 846 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A ATP23P53722 227 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A RSC9Q03124 581 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A NRT1Q08485 598 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PRS5Q12265 496 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A MVD1P32377 396 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SET3P36124 751 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A FMO1P38866 432 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SAK1P38990 1142 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A NUP60P39705 539 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PFA3P42836 336 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SSY5P47002 699 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A FCP1Q03254 732 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A GAD1Q04792 585 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A DUS3Q06053 668 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A GRS2Q06817 618 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A ZRT2Q12436 422 aa0.59□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A ADE8P04161 214 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A TPK2P06245 380 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YER190C-BP0CX94 160 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YEL077W-AP0CX95 160 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YGR296C-BP0CX96 160 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YPL283W-BP0CX97 160 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YPR204C-AP0CX98 160 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A AAD3P25612 363 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A URA1P28272 314 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A ATO2P32907 282 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A AFR1P33304 620 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A TIF3P34167 436 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A FLO5P38894 1075 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A LYS9P38999 446 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A IRR1P40541 1150 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data0.58□□□□□ -2.32not detected
YML054C-AYML054C-A MTL1P53214 551 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A IDP3P53982 420 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A EEB1Q02891 456 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A CTK1Q03957 528 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A SNA4Q07549 140 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A USV1Q12132 391 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A CRC1Q12289 327 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YMR230W-AQ3E7B5 62 aa0.58□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YPT1P01123 206 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A ABF1P14164 731 aa0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A CDC3P32457 520 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A DUT1P33317 147 aa0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A FMP46P36141 133 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A RPS26AP39938 119 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A RPS26BP39939 119 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YGR151CP53287 111 aa0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A ADD37Q03233 198 aa0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YMR317WQ04893 1140 aa0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A HAL9Q12180 1030 aa0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A HER1Q12276 1246 aa0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A GPR1Q12361 961 aa0.57□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A RPS9AO13516 197 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A MRPL9P31334 269 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A CYS3P31373 394 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A PET112P33893 541 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A APD1P38281 316 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A RRT2P38332 387 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YMR124WP39523 943 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A ATG36P46983 293 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data0.56□□□□□ -2.32not detected
YML054C-AYML054C-A CCM1P48237 864 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A LYS20P48570 428 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A SHE10P53075 577 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YGL117WP53133 265 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A VPS16Q03308 798 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A SPO20Q04359 397 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A ENT2Q05785 613 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A VPS36Q06696 566 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A MSC6Q08818 692 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A HAT1Q12341 374 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A CSR2Q12734 1121 aa0.56□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A LEU2P04173 364 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YCP4P25349 247 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A KSP1P38691 1029 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A CRP1P38845 465 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A MTG2P38860 518 aa0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A SIT1P39980 628 aa0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A CFD1P40558 293 aa0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A CPR8P53728 308 aa0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A RSC3Q06639 885 aa0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A RSA1Q08932 381 aa0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A MDM20Q12387 796 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YEL076C-AP0CX16 216 aa0.54□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YLR464WP0CX17 216 aa0.54□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A REV1P12689 985 aa0.54□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A PMA2P19657 947 aa0.54□□□□□ -2.32
YML054C-AYML054C-A YAP1P19880 650 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.1 ms