RNA–Protein interactions for RNA: YLL006W

MMM1, Transcript of ER integral membrane protein, ERMES complex subunit, yeast

Gene MMM1, Length 1,281 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MMM1	YLL006W	YJR120W	P47157	116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	HDA1	P53973	706 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	DLT1	Q04216	342 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	TRM11	Q12463	433 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	MET3	P08536	511 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	HIR1	P32479	840 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	ERT1	P38140	529 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	IES1	P43579	692 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	YKR011C	Q02209	353 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	HFD1	Q04458	532 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	TRE2	Q08693	809 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MMM1	YLL006W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	ELO3	P40319	345 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	PEX14	P53112	341 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	ENT2	Q05785	613 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	RPN12	P32496	274 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MTC2	P34246	357 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	PEA2	P40091	420 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	TOK1	P40310	691 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	SDS3	P40505	327 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	YGR021W	P53212	290 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	ADY4	Q05955	493 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	YBR071W	P38243	211 aa		5	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	RPP1	P38786	293 aa		5	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	FKH2	P41813	862 aa		5	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	LCD1	Q04377	747 aa		5	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	HIF1	Q12373	385 aa		5	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MDM12	Q92328	271 aa		5	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	VBA3	P25594	458 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	REC104	P33323	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	YBR284W	P38150	797 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	YHL017W	P38745	532 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	YHR078W	P38799	552 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MUP1	P50276	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
MMM1	YLL006W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
MMM1	YLL006W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	EUG1	P32474	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	PTH2	P34222	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MAL11	P53048	616 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MRPS35	P53292	345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	ERP4	Q12450	207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	TOP3	P13099	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MEF1	P25039	761 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	VHR1	P40522	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	ALG2	P43636	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	GPG1	P53130	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	COG6	P53959	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	UBX4	P54730	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	MPD2	Q99316	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MMM1	YLL006W	RIM4	P38741	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	RAD18	P10862	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	TFC4	P33339	1025 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	YEL1	P34225	687 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	BLI1	P35727	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	PET10	P36139	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	MGS1	P40151	587 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	PUS2	P53167	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	SUT2	Q12286	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	SRD1	P09007	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	PLC1	P32383	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	VID27	P40157	782 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	PIP2	P52960	996 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	ASI2	P53895	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	CRR1	Q05790	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	AEP2	P22136	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	PTP2	P29461	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	PEX2	P32800	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	YKL133C	P36066	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MMM1	YLL006W	YBR053C	P38235	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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