RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	ADK2	P26364	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	XRS2	P33301	854 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	HEL1	P36113	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YMC2	P38087	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	KIC1	P38692	1080 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YFL052W	P43551	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	TAD1	P53065	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ALF1	P53904	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	STP1	Q00947	519 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	UME1	Q03010	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	OPY2	Q06810	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
FMP46	YKR049C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	AHC1	Q12433	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ECM3	Q99252	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RIF1	P29539	1916 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	GAL80	P04387	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	TPK1	P06244	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	DAL2	P25335	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	OXP1	P28273	1286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CDC11	P32458	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CBF2	P32504	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SLA2	P33338	968 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CCL1	P37366	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	HMT1	P38074	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	STB5	P38699	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	DYS1	P38791	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	XDJ1	P39102	459 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MMM1	P41800	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	IES1	P43579	692 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PHO86	P46956	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	STB4	P50104	949 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MET13	P53128	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ERG5	P54781	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	VPS38	Q05919	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	APL4	Q12028	832 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	REC8	Q12188	680 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	TAO3	P40468	2376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YER152C	P10356	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PEP7	P32609	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MNR2	P35724	969 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	AGP2	P38090	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YBR284W	P38150	797 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	CCC2	P38995	1004 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	GEM1	P39722	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	DSE1	P40077	573 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	FMP10	P40098	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ZAP1	P47043	880 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YJR054W	P47114	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MND1	P53102	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PUS2	P53167	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SPC98	P53540	846 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PNG1	Q02890	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	HEH2	Q03281	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ERV41	Q04651	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	DAS2	Q12084	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PRC1	P00729	532 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	VBA3	P25594	458 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	GAC1	P28006	793 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	HXT1	P32465	570 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	FRE1	P32791	686 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	VBA5	P36172	582 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	JNM1	P36224	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	TBS1	P38114	1094 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	PCH2	P38126	564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	EXO5	P38289	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	YTA12	P40341	825 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FMP46	YKR049C	ATG3	P40344	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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