RNA–Protein interactions for RNA: YJR032W

CPR7, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR7, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR7	YJR032W	SPC29	P33419	253 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
CPR7	YJR032W	YJL206C	P39529	758 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	HUL4	P40985	892 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	CAN1	P04817	590 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	SFB3	P38810	929 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	ATP25	Q03153	612 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	REH1	Q06709	432 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	TAF3	Q12297	353 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	DIF1	O13577	133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	YBR259W	P38338	688 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	YHR112C	P38716	378 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	FMO1	P38866	432 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	YIL166C	P40445	542 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	GAD1	Q04792	585 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CPR7	YJR032W	NDC80	P40460	691 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	SIR3	P06701	978 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	ALY2	P47029	1046 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	COQ11	Q05892	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	MLH3	Q12083	715 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	REV7	P38927	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	DMC1	P25453	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	PHO11	P35842	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	PHO12	P38693	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	AFT2	Q08957	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	NUP60	P39705	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	GET2	P40056	285 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	FHN1	P53279	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	SPO11	P23179	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	YEL020C	P39994	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	MAL11	P53048	616 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	YBP2	P53169	641 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR7	YJR032W	GLG1	P36143	616 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	ECM1	P39715	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	CTR1	P49573	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	YAP1802	P53309	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	HOF1	Q05080	669 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	MTC2	P34246	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	MCD4	P36051	919 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	SET3	P36124	751 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	USV1	Q12132	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	MIH1	P23748	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	GDH3	P39708	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	BDH2	P39713	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	GAL11	P19659	1081 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	SCT1	P32784	759 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	YNL195C	P40168	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	ARG2	P40360	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	ATG4	P53867	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	YAP7	Q08182	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	YKR051W	P36142	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	BNA2	P47125	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	ORC4	P54791	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	ICT1	Q12385	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	CDC9	P04819	755 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	YFL052W	P43551	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	ARP4	P80428	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	OSW1	Q08692	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPR7	YJR032W	YJL049W	P47048	450 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	NPY1	P53164	384 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	NSE3	Q05541	303 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	ECM3	Q99252	613 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	MEF1	P25039	761 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	MCM21	Q06675	368 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	FUB1	P25659	250 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	TMT1	P32643	299 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CPR7	YJR032W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69

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