RNA–Protein interactions for RNA: YHR203C

RPS4B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS4B, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS4B	YHR203C	CCP1	P00431	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	HAP2	P06774	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	GLN3	P18494	730 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	CKA2	P19454	339 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	MRPL33	P20084	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	BET2	P20133	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
RPS4B	YHR203C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	RGD1	P38339	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	SIP3	P38717	1229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	YJL045W	P47052	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	CTF18	P49956	741 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	CUL3	P53202	744 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	YNL146W	P53906	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	ECM7	Q06200	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	IES4	Q08561	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	ALG1	P16661	449 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
RPS4B	YHR203C	RAD27	P26793	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	RRN6	P32786	894 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	HEL1	P36113	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	UBP13	P38187	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	RFC5	P38251	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	VID24	P38263	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	PIH1	P38768	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	NUP82	P40368	713 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	YIR016W	P40572	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
RPS4B	YHR203C	AVT1	P47082	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	BFA1	P47113	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	SEC5	P89102	971 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	IRC10	Q08118	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	ELG1	Q12050	791 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	REC8	Q12188	680 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	RRD2	Q12461	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS4B	YHR203C	MAS1	P10507	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	TAF13	P11747	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	HMG2	P12684	1045 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	APE1	P14904	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	VMA3	P25515	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	GCS1	P35197	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	MMS4	P38257	691 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	QDR2	P40474	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	MAF1	P41910	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	MTO1	P53070	669 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	NUT1	P53114	1132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CUZ1	P53899	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PLP2	Q12017	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	DCS2	Q12123	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CCH1	P50077	2039 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	VPS3	P23643	1011 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	KAP122	P32767	1081 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	TRM2	P33753	639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	MRPL16	P38064	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	HMT1	P38074	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SAF1	P38352	637 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YER186C	P40101	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	UBA2	P52488	636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PEX14	P53112	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	VTC3	Q02725	835 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ADY4	Q05955	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CUR1	Q06469	252 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SHS1	Q07657	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	APC11	Q12157	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	FAB1	P34756	2278 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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