RNA–Protein interactions for RNA: YHR201C

PPX1, Transcript of Exopolyphosphatase, yeast

Gene PPX1, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPX1	YHR201C	CIT1	P00890	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	DAL7	P21826	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	ELO3	P40319	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	MRPS35	P53292	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	YPT53	P36019	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	PPS1	P38148	807 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	HUL4	P40985	892 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	STU2	P46675	888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	PKH1	Q03407	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	PRC1	P00729	532 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	PZF1	P39933	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	MUP1	P50276	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	ASI2	P53895	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	STU1	P38198	1513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	YCL002C	P25565	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	EMC3	P36039	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	SAP190	P36123	1033 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	SAK1	P38990	1142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	GYP8	P43570	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	TAD1	P53065	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPX1	YHR201C	NGG1	P32494	702 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	SSY5	P47002	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	GND2	P53319	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YML122C	Q03207	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	TAF8	Q03750	510 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	ADY4	Q05955	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	IRC10	Q08118	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	FLC1	Q08967	793 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	MTH1	P35198	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	SPC42	P36094	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	DAM1	P53267	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	CRR1	Q05790	422 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	RSC3	Q06639	885 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	BET3	P36149	193 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	DAS1	P47005	663 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	HUL5	P53119	910 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YBR053C	P38235	358 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YHL017W	P38745	532 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	PFA3	P42836	336 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	ALG2	P43636	503 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YJL049W	P47048	450 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	AMA1	P50082	593 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	NRG1	Q03125	231 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	REH1	Q06709	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YLR415C	O13578	112 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
PPX1	YHR201C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	SDS3	P40505	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YJL163C	P46996	555 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	RTA1	P53047	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	YBT1	P32386	1661 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	MET7	Q08645	548 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	THI21	Q08975	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	STH1	P32597	1359 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PPX1	YHR201C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	CAN1	P04817	590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	YIR042C	P40586	236 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	SHR5	P41912	237 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	IRC13	Q08630	104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	PCL5	P38794	229 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	ASM4	Q05166	528 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	GAL11	P19659	1081 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	PER1	P25625	357 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	ATF1	P40353	525 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	ATP25	Q03153	612 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	BDF2	Q07442	638 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	TGL5	Q12043	749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	DIF1	O13577	133 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	SPC29	P33419	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	ZIP2	P53061	704 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	RIA1	P53893	1110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PPX1	YHR201C	GPR1	Q12361	961 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.5 ms